Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRIP30626 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRIP30626 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRIP30626 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRIP30626 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRIP30626 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRIP30626 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRIP30626 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRIP30626 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRIP30626 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRIP30626 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRIP30626 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRIP30626 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRIP30626 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRIP30626 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRIP30626 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRIP30626 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRIP30626 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRIP30626 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRIP30626 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRIP30626 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRIP30626 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRIP30626 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRIP30626 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRIP30626 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRIP30626 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRIP30626 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRIP30626 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRIP30626 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRIP30626 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRIP30626 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRIP30626 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRIP30626 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRIP30626 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRIP30626 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRIP30626 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRIP30626 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRIP30626 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRIP30626 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRIP30626 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRIP30626 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRIP30626 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRIP30626 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRIP30626 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRIP30626 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRIP30626 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRIP30626 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRIP30626 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRIP30626 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRIP30626 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRIP30626 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms