Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHC1P29353 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHC1P29353 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHC1P29353 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHC1P29353 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHC1P29353 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHC1P29353 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHC1P29353 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHC1P29353 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHC1P29353 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHC1P29353 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHC1P29353 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHC1P29353 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHC1P29353 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHC1P29353 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHC1P29353 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHC1P29353 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHC1P29353 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHC1P29353 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHC1P29353 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHC1P29353 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHC1P29353 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHC1P29353 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC1P29353 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC1P29353 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC1P29353 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC1P29353 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC1P29353 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC1P29353 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC1P29353 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC1P29353 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC1P29353 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC1P29353 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC1P29353 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC1P29353 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC1P29353 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC1P29353 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC1P29353 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC1P29353 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC1P29353 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC1P29353 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC1P29353 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC1P29353 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC1P29353 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC1P29353 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC1P29353 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC1P29353 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC1P29353 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC1P29353 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms