Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR2AP28223 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR2AP28223 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR2AP28223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR2AP28223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR2AP28223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms