Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX1P27695 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX1P27695 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX1P27695 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX1P27695 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX1P27695 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX1P27695 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX1P27695 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX1P27695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX1P27695 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX1P27695 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX1P27695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX1P27695 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX1P27695 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX1P27695 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX1P27695 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX1P27695 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX1P27695 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX1P27695 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX1P27695 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX1P27695 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APEX1P27695 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APEX1P27695 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX1P27695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX1P27695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX1P27695 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APEX1P27695 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX1P27695 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX1P27695 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX1P27695 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APEX1P27695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX1P27695 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX1P27695 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX1P27695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX1P27695 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APEX1P27695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APEX1P27695 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APEX1P27695 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APEX1P27695 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX1P27695 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX1P27695 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX1P27695 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX1P27695 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX1P27695 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms