Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIFP27352 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIFP27352 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GIFP27352 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIFP27352 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIFP27352 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIFP27352 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIFP27352 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIFP27352 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIFP27352 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIFP27352 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIFP27352 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GIFP27352 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIFP27352 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIFP27352 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIFP27352 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIFP27352 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIFP27352 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIFP27352 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIFP27352 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIFP27352 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIFP27352 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIFP27352 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIFP27352 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIFP27352 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIFP27352 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GIFP27352 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIFP27352 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIFP27352 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIFP27352 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIFP27352 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIFP27352 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIFP27352 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIFP27352 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIFP27352 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIFP27352 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIFP27352 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIFP27352 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIFP27352 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIFP27352 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIFP27352 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIFP27352 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIFP27352 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIFP27352 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIFP27352 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIFP27352 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIFP27352 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIFP27352 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIFP27352 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIFP27352 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms