Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDELR1P24390 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDELR1P24390 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDELR1P24390 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDELR1P24390 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDELR1P24390 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms