Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA2P20248 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA2P20248 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA2P20248 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA2P20248 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms