Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB4P17483 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB4P17483 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms