Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF28P17035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF28P17035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF28P17035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF28P17035 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms