Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
VEGFAP15692 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VEGFAP15692 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VEGFAP15692 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms