Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGAMP11215 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAMP11215 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGAMP11215 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAMP11215 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms