Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HKR1P10072 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HKR1P10072 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HKR1P10072 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HKR1P10072 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HKR1P10072 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HKR1P10072 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HKR1P10072 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HKR1P10072 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HKR1P10072 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HKR1P10072 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HKR1P10072 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HKR1P10072 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HKR1P10072 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HKR1P10072 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HKR1P10072 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HKR1P10072 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HKR1P10072 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HKR1P10072 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HKR1P10072 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HKR1P10072 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HKR1P10072 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HKR1P10072 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HKR1P10072 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HKR1P10072 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HKR1P10072 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HKR1P10072 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HKR1P10072 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HKR1P10072 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HKR1P10072 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HKR1P10072 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HKR1P10072 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HKR1P10072 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HKR1P10072 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HKR1P10072 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HKR1P10072 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HKR1P10072 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HKR1P10072 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HKR1P10072 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HKR1P10072 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HKR1P10072 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HKR1P10072 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HKR1P10072 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HKR1P10072 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HKR1P10072 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HKR1P10072 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HKR1P10072 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HKR1P10072 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HKR1P10072 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms