Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM13P0DJ93 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM13P0DJ93 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms