Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3P05106 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB3P05106 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB3P05106 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB3P05106 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3P05106 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms