Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT1P04264 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT1P04264 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT1P04264 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT1P04264 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT1P04264 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT1P04264 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT1P04264 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT1P04264 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT1P04264 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT1P04264 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT1P04264 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT1P04264 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT1P04264 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT1P04264 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT1P04264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT1P04264 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT1P04264 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT1P04264 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT1P04264 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT1P04264 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT1P04264 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT1P04264 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT1P04264 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT1P04264 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT1P04264 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT1P04264 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT1P04264 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT1P04264 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT1P04264 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT1P04264 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT1P04264 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT1P04264 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT1P04264 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT1P04264 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT1P04264 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT1P04264 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT1P04264 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT1P04264 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT1P04264 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT1P04264 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT1P04264 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT1P04264 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT1P04264 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT1P04264 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT1P04264 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT1P04264 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT1P04264 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT1P04264 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT1P04264 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT1P04264 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT1P04264 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT1P04264 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT1P04264 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT1P04264 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT1P04264 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT1P04264 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT1P04264 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT1P04264 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT1P04264 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT1P04264 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms