Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFP02787 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFP02787 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFP02787 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFP02787 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFP02787 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFP02787 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFP02787 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFP02787 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFP02787 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFP02787 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFP02787 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFP02787 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFP02787 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFP02787 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFP02787 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFP02787 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFP02787 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFP02787 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFP02787 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFP02787 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TFP02787 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFP02787 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFP02787 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFP02787 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TFP02787 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFP02787 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFP02787 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFP02787 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFP02787 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFP02787 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFP02787 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFP02787 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFP02787 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFP02787 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFP02787 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFP02787 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFP02787 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFP02787 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFP02787 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TFP02787 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFP02787 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFP02787 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TFP02787 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFP02787 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFP02787 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFP02787 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFP02787 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFP02787 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFP02787 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFP02787 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFP02787 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFP02787 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFP02787 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFP02787 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFP02787 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFP02787 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms