Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX3O95076 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX3O95076 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX3O95076 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX3O95076 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX3O95076 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX3O95076 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX3O95076 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX3O95076 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX3O95076 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX3O95076 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX3O95076 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX3O95076 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX3O95076 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX3O95076 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX3O95076 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX3O95076 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX3O95076 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX3O95076 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALX3O95076 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX3O95076 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX3O95076 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX3O95076 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX3O95076 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX3O95076 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX3O95076 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX3O95076 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX3O95076 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX3O95076 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX3O95076 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX3O95076 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX3O95076 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX3O95076 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX3O95076 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX3O95076 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX3O95076 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX3O95076 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX3O95076 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX3O95076 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX3O95076 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX3O95076 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX3O95076 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX3O95076 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX3O95076 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX3O95076 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX3O95076 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX3O95076 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX3O95076 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX3O95076 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX3O95076 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX3O95076 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX3O95076 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX3O95076 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX3O95076 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX3O95076 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX3O95076 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX3O95076 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX3O95076 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX3O95076 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX3O95076 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX3O95076 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX3O95076 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX3O95076 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALX3O95076 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALX3O95076 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX3O95076 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALX3O95076 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms