Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB3O75712 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB3O75712 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB3O75712 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB3O75712 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB3O75712 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB3O75712 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB3O75712 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB3O75712 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB3O75712 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB3O75712 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB3O75712 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB3O75712 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB3O75712 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB3O75712 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB3O75712 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB3O75712 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB3O75712 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB3O75712 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB3O75712 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB3O75712 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB3O75712 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB3O75712 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB3O75712 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB3O75712 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB3O75712 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB3O75712 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB3O75712 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB3O75712 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB3O75712 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB3O75712 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB3O75712 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB3O75712 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB3O75712 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB3O75712 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB3O75712 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB3O75712 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB3O75712 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB3O75712 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB3O75712 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB3O75712 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB3O75712 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB3O75712 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB3O75712 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB3O75712 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB3O75712 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB3O75712 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB3O75712 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB3O75712 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB3O75712 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB3O75712 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB3O75712 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB3O75712 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB3O75712 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB3O75712 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB3O75712 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB3O75712 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB3O75712 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB3O75712 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB3O75712 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB3O75712 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB3O75712 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB3O75712 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB3O75712 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB3O75712 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB3O75712 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB3O75712 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms