Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
BRD4O60885 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BRD4O60885 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRD4O60885 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRD4O60885 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BRD4O60885 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRD4O60885 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRD4O60885 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BRD4O60885 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRD4O60885 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRD4O60885 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BRD4O60885 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BRD4O60885 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BRD4O60885 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BRD4O60885 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
BRD4O60885 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRD4O60885 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRD4O60885 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRD4O60885 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRD4O60885 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRD4O60885 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BRD4O60885 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BRD4O60885 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRD4O60885 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRD4O60885 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BRD4O60885 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRD4O60885 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
BRD4O60885 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BRD4O60885 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRD4O60885 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRD4O60885 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BRD4O60885 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
BRD4O60885 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
BRD4O60885 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRD4O60885 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRD4O60885 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BRD4O60885 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
BRD4O60885 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
BRD4O60885 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRD4O60885 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRD4O60885 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRD4O60885 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BRD4O60885 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRD4O60885 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRD4O60885 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRD4O60885 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BRD4O60885 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRD4O60885 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRD4O60885 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRD4O60885 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BRD4O60885 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BRD4O60885 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BRD4O60885 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BRD4O60885 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BRD4O60885 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BRD4O60885 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BRD4O60885 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BRD4O60885 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BRD4O60885 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BRD4O60885 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BRD4O60885 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
BRD4O60885 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BRD4O60885 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BRD4O60885 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BRD4O60885 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BRD4O60885 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BRD4O60885 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BRD4O60885 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BRD4O60885 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BRD4O60885 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BRD4O60885 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BRD4O60885 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
BRD4O60885 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRD4O60885 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
BRD4O60885 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
BRD4O60885 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BRD4O60885 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BRD4O60885 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BRD4O60885 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BRD4O60885 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BRD4O60885 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BRD4O60885 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BRD4O60885 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BRD4O60885 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BRD4O60885 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
BRD4O60885 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BRD4O60885 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BRD4O60885 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BRD4O60885 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms