Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RASA4O43374 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RASA4O43374 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASA4O43374 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASA4O43374 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASA4O43374 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASA4O43374 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASA4O43374 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASA4O43374 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RASA4O43374 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASA4O43374 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASA4O43374 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RASA4O43374 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASA4O43374 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASA4O43374 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASA4O43374 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASA4O43374 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASA4O43374 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RASA4O43374 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASA4O43374 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASA4O43374 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASA4O43374 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RASA4O43374 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASA4O43374 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASA4O43374 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASA4O43374 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RASA4O43374 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASA4O43374 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RASA4O43374 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RASA4O43374 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASA4O43374 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASA4O43374 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RASA4O43374 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RASA4O43374 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASA4O43374 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASA4O43374 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASA4O43374 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASA4O43374 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASA4O43374 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASA4O43374 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASA4O43374 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASA4O43374 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASA4O43374 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASA4O43374 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASA4O43374 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RASA4O43374 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASA4O43374 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASA4O43374 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RASA4O43374 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RASA4O43374 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASA4O43374 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASA4O43374 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASA4O43374 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASA4O43374 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASA4O43374 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASA4O43374 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASA4O43374 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASA4O43374 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASA4O43374 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASA4O43374 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASA4O43374 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASA4O43374 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASA4O43374 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASA4O43374 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms