Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC01565O15544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC01565O15544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC01565O15544 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC01565O15544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms