Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSO14618 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSO14618 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSO14618 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSO14618 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSO14618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSO14618 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSO14618 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSO14618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSO14618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSO14618 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSO14618 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSO14618 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSO14618 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSO14618 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSO14618 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSO14618 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSO14618 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSO14618 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSO14618 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSO14618 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSO14618 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSO14618 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSO14618 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSO14618 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSO14618 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSO14618 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSO14618 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSO14618 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSO14618 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCSO14618 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCSO14618 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCSO14618 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCSO14618 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCSO14618 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCSO14618 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCSO14618 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCSO14618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCSO14618 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCSO14618 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCSO14618 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCSO14618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCSO14618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCSO14618 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCSO14618 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCSO14618 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSO14618 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSO14618 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSO14618 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSO14618 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSO14618 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSO14618 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSO14618 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSO14618 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSO14618 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSO14618 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSO14618 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSO14618 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSO14618 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSO14618 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSO14618 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSO14618 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSO14618 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSO14618 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCSO14618 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCSO14618 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCSO14618 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCSO14618 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCSO14618 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSO14618 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSO14618 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSO14618 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSO14618 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSO14618 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSO14618 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSO14618 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSO14618 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms