Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2O14595 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2O14595 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2O14595 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2O14595 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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