Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM38O00635 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM38O00635 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM38O00635 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms