Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QRK9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QRK9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QRK9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QRK9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QRK9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QRK9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QRK9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QRK9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QRK9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QRK9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QRK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QRK9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QRK9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QRK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QRK9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
J3QRK9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QRK9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QRK9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QRK9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QRK9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QRK9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QRK9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QRK9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QRK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QRK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QRK9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QRK9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QRK9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3QRK9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3QRK9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QRK9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QRK9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QRK9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QRK9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QRK9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QRK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QRK9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QRK9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QRK9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QRK9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRK9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRK9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRK9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRK9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRK9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRK9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRK9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRK9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRK9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QRK9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QRK9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRK9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRK9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRK9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRK9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRK9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRK9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRK9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRK9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRK9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRK9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms