Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QRE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRE1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRE1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QRE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QRE1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QRE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QRE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QRE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QRE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QRE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QRE1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QRE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QRE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QRE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QRE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRE1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QRE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QRE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QRE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRE1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QRE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QRE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QRE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QRE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QRE1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QRE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QRE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms