Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85CA6NKD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85CA6NKD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85CA6NKD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85CA6NKD9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85CA6NKD9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms