Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO3A2RU48 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMCO3A2RU48 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO3A2RU48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms