Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GVG6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1B0GVG6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1B0GVG6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GVG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1B0GVG6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms