Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms