RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)Q1

tM(CAU)Q1, Transcript of Mitochondrial methionine tRNA (tRNA-Met), yeastyeast

Gene tM(CAU)Q1, Length 76 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 FAP1P53971 965 aa13.14□□□□□ -0.31
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PRY3P47033 881 aa12.41□□□□□ -0.42
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AAD16Q02895 342 aa11.86□□□□□ -0.51
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PRI1P10363 409 aa11.84□□□□□ -0.51
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YCK3P39962 524 aa11.76□□□□□ -0.53
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ISW2Q08773 1120 aa11.3□□□□□ -0.6
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MRPL32P25348 183 aa10.69□□□□□ -0.7
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YGL015CP33199 130 aa10.46□□□□□ -0.73
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 REB1P21538 810 aa10.23□□□□□ -0.77
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CDC27P38042 758 aa10.09□□□□□ -0.79
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AVT3P36062 692 aa9.97□□□□□ -0.81
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SPT21P35209 758 aa9.71□□□□□ -0.86
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DCD1P06773 312 aa9.7□□□□□ -0.86
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 HOP09932 586 aa9.68□□□□□ -0.86
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TFC8Q12308 588 aa9.6□□□□□ -0.87
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SCY1P53009 804 aa9.5□□□□□ -0.89
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TGL3P40308 642 aa9.36□□□□□ -0.91
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 UBP9P39967 754 aa9.3□□□□□ -0.92
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BCH2P36122 765 aa9.28□□□□□ -0.92
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RIM101P33400 625 aa9.17□□□□□ -0.94
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 EPS1P40557 701 aa8.97□□□□□ -0.97
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BDF1P35817 686 aa8.96□□□□□ -0.98
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YBL029C-AQ3E756 94 aa8.95□□□□□ -0.98
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 OXP1P28273 1286 aa8.9□□□□□ -0.98
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MST1P07236 462 aa8.87□□□□□ -0.99
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YOR238WQ08634 303 aa8.8□□□□□ -1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 VNX1P42839 908 aa8.78□□□□□ -1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PTP3P40048 928 aa8.75□□□□□ -1.01
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 WSC3Q12215 556 aa8.7□□□□□ -1.02
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SPP1Q03012 353 aa8.68□□□□□ -1.02
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.63□□□□□ -1.03not detected
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YAP5P40574 245 aa8.61□□□□□ -1.03
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AI2P03876 854 aa8.58□□□□□ -1.04
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BBC1P47068 1157 aa8.58□□□□□ -1.04
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RSM7P47150 247 aa8.57□□□□□ -1.04
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 FKH1P40466 484 aa8.52□□□□□ -1.05
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YJL171CP46992 396 aa8.52□□□□□ -1.05
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 GTT3P39996 337 aa8.46□□□□□ -1.06
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PIB1Q06651 286 aa8.45□□□□□ -1.06
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 LDB19Q12502 818 aa8.44□□□□□ -1.06
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ULI1P43604 169 aa8.4□□□□□ -1.06
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 IOC2Q12072 812 aa8.39□□□□□ -1.07
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BMT6Q12291 365 aa8.34□□□□□ -1.07
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YLR271WQ06152 274 aa8.31□□□□□ -1.08
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MRM1P25270 412 aa8.26□□□□□ -1.09
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RTG1P32607 177 aa8.2□□□□□ -1.1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SET4P42948 560 aa8.2□□□□□ -1.1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YOL036WQ08206 761 aa8.17□□□□□ -1.1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MSB4Q12317 492 aa8.17□□□□□ -1.1
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 NCR1Q12200 1170 aa8.14□□□□□ -1.11
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YFR006WP43590 535 aa8.12□□□□□ -1.11
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 VPS29P38759 282 aa8.08□□□□□ -1.12
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.05□□□□□ -1.12not detected
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SEC61P32915 480 aa8.03□□□□□ -1.12
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 STS1P38637 319 aa8.03□□□□□ -1.12
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CST9Q06032 482 aa8.01□□□□□ -1.13
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SAP30P38429 201 aa7.97□□□□□ -1.13
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SAM3Q08986 587 aa7.96□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RTG3P38165 486 aa7.95□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SSP1P38871 571 aa7.94□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RCR1P38212 213 aa7.93□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DAN4P47179 1161 aa7.93□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.92□□□□□ -1.14 RIP-Chip
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BCK2P33306 851 aa7.9□□□□□ -1.14
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YDL129WQ07555 291 aa7.86□□□□□ -1.15
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 GYP5Q12344 894 aa7.85□□□□□ -1.15
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DCW1P36091 449 aa7.84□□□□□ -1.15
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 JIP4Q03361 876 aa7.84□□□□□ -1.15
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TFA1P36100 482 aa7.82□□□□□ -1.16
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MGA2P40578 1113 aa7.82□□□□□ -1.16
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YDR344CQ05510 147 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms