RNA–Protein interactions for RNA: YPR174C

YPR174C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YPR174C, Length 666 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR174CYPR174C MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
YPR174CYPR174C DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
YPR174CYPR174C FAP1P53971 965 aa10.24□□□□□ -0.77
YPR174CYPR174C PRI1P10363 409 aa9.64□□□□□ -0.87
YPR174CYPR174C PRY3P47033 881 aa9.61□□□□□ -0.87
YPR174CYPR174C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
YPR174CYPR174C AAD16Q02895 342 aa9.56□□□□□ -0.88
YPR174CYPR174C ISW2Q08773 1120 aa9.54□□□□□ -0.88
YPR174CYPR174C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YPR174CYPR174C AVT3P36062 692 aa9.25□□□□□ -0.93
YPR174CYPR174C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
YPR174CYPR174C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YPR174CYPR174C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
YPR174CYPR174C YCK3P39962 524 aa9.04□□□□□ -0.96
YPR174CYPR174C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YPR174CYPR174C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
YPR174CYPR174C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
YPR174CYPR174C REB1P21538 810 aa8.85□□□□□ -0.99
YPR174CYPR174C MRPL32P25348 183 aa8.78□□□□□ -1
YPR174CYPR174C SPT21P35209 758 aa8.5□□□□□ -1.05
YPR174CYPR174C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YPR174CYPR174C CDC27P38042 758 aa8.37□□□□□ -1.07
YPR174CYPR174C INO80P53115 1489 aa8.35□□□□□ -1.07
YPR174CYPR174C YGL015CP33199 130 aa8.35□□□□□ -1.07
YPR174CYPR174C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YPR174CYPR174C RIM101P33400 625 aa8.25□□□□□ -1.09
YPR174CYPR174C HOP09932 586 aa8.24□□□□□ -1.09
YPR174CYPR174C TFA1P36100 482 aa8.22□□□□□ -1.09
YPR174CYPR174C DCD1P06773 312 aa8.2□□□□□ -1.1
YPR174CYPR174C TFC8Q12308 588 aa8.2□□□□□ -1.1
YPR174CYPR174C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YPR174CYPR174C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
YPR174CYPR174C OXP1P28273 1286 aa7.99□□□□□ -1.13
YPR174CYPR174C SCY1P53009 804 aa7.97□□□□□ -1.13
YPR174CYPR174C DNA2P38859 1522 aa7.97□□□□□ -1.13
YPR174CYPR174C BCH2P36122 765 aa7.96□□□□□ -1.14
YPR174CYPR174C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
YPR174CYPR174C PTP3P40048 928 aa7.88□□□□□ -1.15
YPR174CYPR174C SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
YPR174CYPR174C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
YPR174CYPR174C EPS1P40557 701 aa7.77□□□□□ -1.17
YPR174CYPR174C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YPR174CYPR174C RSM7P47150 247 aa7.75□□□□□ -1.17
YPR174CYPR174C BDF1P35817 686 aa7.73□□□□□ -1.17
YPR174CYPR174C TGL3P40308 642 aa7.71□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C AI2P03876 854 aa7.67□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C BBC1P47068 1157 aa7.67□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C YLR271WQ06152 274 aa7.66□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C SWR1Q05471 1514 aa7.66□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C KOG1P38873 1557 aa7.66□□□□□ -1.18
YPR174CYPR174C SSP1P38871 571 aa7.61□□□□□ -1.19
YPR174CYPR174C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
YPR174CYPR174C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.55□□□□□ -1.2not detected
YPR174CYPR174C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
YPR174CYPR174C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YPR174CYPR174C UBP9P39967 754 aa7.43□□□□□ -1.22
YPR174CYPR174C MRM1P25270 412 aa7.42□□□□□ -1.22
YPR174CYPR174C YOR238WQ08634 303 aa7.42□□□□□ -1.22
YPR174CYPR174C CST9Q06032 482 aa7.41□□□□□ -1.22
YPR174CYPR174C MGA2P40578 1113 aa7.4□□□□□ -1.22
YPR174CYPR174C MST1P07236 462 aa7.39□□□□□ -1.23
YPR174CYPR174C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.39□□□□□ -1.23not detected
YPR174CYPR174C YAP5P40574 245 aa7.39□□□□□ -1.23
YPR174CYPR174C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YPR174CYPR174C TAF7Q05021 590 aa7.34□□□□□ -1.23
YPR174CYPR174C TY1B-DR4Q07793 1604 aa7.3□□□□□ -1.24
YPR174CYPR174C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.29□□□□□ -1.24
YPR174CYPR174C PIB1Q06651 286 aa7.28□□□□□ -1.24
YPR174CYPR174C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPR174CYPR174C RTG3P38165 486 aa7.25□□□□□ -1.25
YPR174CYPR174C GTT3P39996 337 aa7.24□□□□□ -1.25
YPR174CYPR174C VPS29P38759 282 aa7.23□□□□□ -1.25
YPR174CYPR174C WSC3Q12215 556 aa7.23□□□□□ -1.25
YPR174CYPR174C RCR1P38212 213 aa7.21□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C VNX1P42839 908 aa7.21□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.2□□□□□ -1.26not detected
YPR174CYPR174C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C MIF2P35201 549 aa7.18□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C YFR006WP43590 535 aa7.18□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C SPP1Q03012 353 aa7.16□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C STS1P38637 319 aa7.15□□□□□ -1.26
YPR174CYPR174C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YPR174CYPR174C ECM5Q03214 1411 aa7.09□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C SET4P42948 560 aa7.05□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C RAM2P29703 316 aa7.04□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C ULI1P43604 169 aa7.04□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C YOL036WQ08206 761 aa7.04□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C MSB4Q12317 492 aa7.03□□□□□ -1.28
YPR174CYPR174C SAM3Q08986 587 aa7.01□□□□□ -1.29
YPR174CYPR174C EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YPR174CYPR174C IOC2Q12072 812 aa6.99□□□□□ -1.29
YPR174CYPR174C LDB19Q12502 818 aa6.99□□□□□ -1.29
YPR174CYPR174C MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YPR174CYPR174C TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YPR174CYPR174C FKH1P40466 484 aa6.95□□□□□ -1.3
YPR174CYPR174C GYP5Q12344 894 aa6.95□□□□□ -1.3
YPR174CYPR174C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
YPR174CYPR174C REV3P14284 1504 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms