RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.61□□□□□ -0.55
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEDQ86YR6 584 aa11.33□□□□□ -0.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 MSH5O43196 834 aa9.83□□□□□ -0.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOXD1Q16676 465 aa9.8□□□□□ -0.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.09□□□□□ -0.95
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADRA2BP18089 450 aa9.07□□□□□ -0.96
RNU6-344P-201ENST00000516635 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEHQ6S545 545 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNA4P22459 653 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF39Q9H2S5 420 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RNU6-344P-201ENST00000516635 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-344P-201ENST00000516635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-344P-201ENST00000516635 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB22O15209 634 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC4A2P04920 1241 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-344P-201ENST00000516635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-344P-201ENST00000516635 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 DSG3P32926 999 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAPN15O75808 1086 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LHX8Q68G74 356 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-344P-201ENST00000516635 APLP2Q06481 763 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABCB7O75027 752 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLA2Q14181 598 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-344P-201ENST00000516635 HAX1O00165 279 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-344P-201ENST00000516635 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBLN2P98095 1184 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-344P-201ENST00000516635 FKBP8Q14318 412 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 OSCARQ8IYS5 282 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEMA6NI47 508 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEGQ6S5H5 508 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 EVX2Q03828 476 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPDYE6P0CI01 402 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 AKT1S1Q96B36 256 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 PROM2Q8N271 834 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 GABBR2O75899 941 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-344P-201ENST00000516635 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-344P-201ENST00000516635 PITPNM1O00562 1244 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-344P-201ENST00000516635 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO3Q9UK99 471 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR29P0C7W0 189 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLCN6P51797 869 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OTUD5Q96G74 571 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MIER1Q8N108 512 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHADLQ6NUI6 762 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-344P-201ENST00000516635 CREBZFQ9NS37 354 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTEIP0CG38 1075 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL34Q8N239 644 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLEKHG5O94827 1062 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPOCK2Q92563 424 aa6.26□□□□□ -1.41
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