RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494188.1

RAB1A-205, Transcript of RAB1A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB1A, Length 771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1A-205ENST00000494188 ERBINQ96RT1 1412 aa35.05■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.02■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 MROH2AA6NES4 1674 aa35.01■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 C3P01024 1663 aa35.01■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.97■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.96■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 ZMYM3Q14202 1370 aa34.95■■■■□ 3.19
RAB1A-205ENST00000494188 ROCK1Q13464 1354 aa34.94■■■■□ 3.18
RAB1A-205ENST00000494188 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.93■■■■□ 3.18
RAB1A-205ENST00000494188 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.92■■■■□ 3.18
RAB1A-205ENST00000494188 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.89■■■■□ 3.18
RAB1A-205ENST00000494188 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC3O15438 1527 aa34.86■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 DEPDC5O75140 1603 aa34.85■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.83■■■■□ 3.17
RAB1A-205ENST00000494188 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.82■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 CEP152O94986 1710 aa34.81■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 NPATQ14207 1427 aa34.81■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 KANK1Q14678 1352 aa34.79■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.78■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 PZPP20742 1482 aa34.78■■■■□ 3.16
RAB1A-205ENST00000494188 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.74■■■■□ 3.15
RAB1A-205ENST00000494188 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.7■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 UNC13BO14795 1591 aa34.69■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 HSPA2P54652 639 aa34.68■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.67■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.66■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.66■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 NAIPQ13075 1403 aa34.65■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 TNRQ92752 1358 aa34.64■■■■□ 3.14
RAB1A-205ENST00000494188 HFM1A2PYH4 1435 aa34.62■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.61■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 ERVK-7P63135 1459 aa34.6■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.58■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.58■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
RAB1A-205ENST00000494188 NUP155O75694 1391 aa34.54■■■■□ 3.12
RAB1A-205ENST00000494188 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.53■■■■□ 3.12
RAB1A-205ENST00000494188 TET3O43151 1660 aa34.53■■■■□ 3.12
RAB1A-205ENST00000494188 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.52■■■■□ 3.12
RAB1A-205ENST00000494188 NLRP1Q9C000 1473 aa34.5■■■■□ 3.11
RAB1A-205ENST00000494188 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
RAB1A-205ENST00000494188 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
RAB1A-205ENST00000494188 TRIM52Q96A61 297 aa34.4■■■■□ 3.1
RAB1A-205ENST00000494188 E9PCH4 1651 aa34.39■■■■□ 3.1
RAB1A-205ENST00000494188 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.39■■■■□ 3.1
RAB1A-205ENST00000494188 NOS1P29475 1434 aa34.38■■■■□ 3.09
RAB1A-205ENST00000494188 SYNMO15061 1565 aa34.37■■■■□ 3.09
RAB1A-205ENST00000494188 STRCQ7RTU9 1775 aa34.36■■■■□ 3.09
RAB1A-205ENST00000494188 PLA2R1Q13018 1463 aa34.35■■■■□ 3.09
RAB1A-205ENST00000494188 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.33■■■■□ 3.09
RAB1A-205ENST00000494188 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
RAB1A-205ENST00000494188 PIK3C2BO00750 1634 aa34.3■■■■□ 3.08
RAB1A-205ENST00000494188 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.28■■■■□ 3.08
RAB1A-205ENST00000494188 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.27■■■■□ 3.08
RAB1A-205ENST00000494188 IDI1Q13907 227 aa34.26■■■■□ 3.08
RAB1A-205ENST00000494188 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.25■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.25■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.25■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 PKD2Q13563 968 aa34.23■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.23■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 ADGRB3O60242 1522 aa34.2■■■■□ 3.07
RAB1A-205ENST00000494188 PTPRTO14522 1441 aa34.2■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.19■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.17■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.14■■■■□ 3.06
RAB1A-205ENST00000494188 SLIT1O75093 1534 aa34.13■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.11■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 TRPM2O94759 1503 aa34.1■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.1■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.1■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.08■■■■□ 3.05
RAB1A-205ENST00000494188 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
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RAB1A-205ENST00000494188 EID1Q9Y6B2 187 aa34.05■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 MED14O60244 1454 aa34.04■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.04■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 CLTCL1P53675 1640 aa34.04■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 LTKP29376 864 aa34.02■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 IQGAP1P46940 1657 aa34.01■■■■□ 3.04
RAB1A-205ENST00000494188 HRCP23327 699 aa33.98■■■■□ 3.03
RAB1A-205ENST00000494188 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.96■■■■□ 3.03
RAB1A-205ENST00000494188 ZFYVE9O95405 1425 aa33.94■■■■□ 3.02
RAB1A-205ENST00000494188 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
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