RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494188.1

RAB1A-205, Transcript of RAB1A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB1A, Length 771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1A-205ENST00000494188 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.17■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 RAPGEF3O95398 923 aa36.16■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 APLP2Q06481 763 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.1■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 RICTORQ6R327 1708 aa36.08■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 NCOA2Q15596 1464 aa36.07■■■■□ 3.37
RAB1A-205ENST00000494188 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.04■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.02■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC1P33527 1531 aa36.01■■■■□ 3.36
RAB1A-205ENST00000494188 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.98■■■■□ 3.35
RAB1A-205ENST00000494188 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.97■■■■□ 3.35
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.94■■■■□ 3.34
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.93■■■■□ 3.34
RAB1A-205ENST00000494188 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.9■■■■□ 3.34
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.89■■■■□ 3.34
RAB1A-205ENST00000494188 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.88■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.88■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 AFAP1Q8N556 730 aa35.87■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.87■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.86■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 KDM5CP41229 1560 aa35.86■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.83■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.83■■■■□ 3.33
RAB1A-205ENST00000494188 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
RAB1A-205ENST00000494188 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.81■■■■□ 3.324e-7■■■□□ 18.1
RAB1A-205ENST00000494188 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.8■■■■□ 3.32
RAB1A-205ENST00000494188 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.8■■■■□ 3.32
RAB1A-205ENST00000494188 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.78■■■■□ 3.32
RAB1A-205ENST00000494188 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.78■■■■□ 3.32
RAB1A-205ENST00000494188 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.73■■■■□ 3.31
RAB1A-205ENST00000494188 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB1A-205ENST00000494188 MIA2Q96PC5 1412 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB1A-205ENST00000494188 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 MBD5Q9P267 1494 aa35.68■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 ATP10AO60312 1499 aa35.67■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.66■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 ABCA6Q8N139 1617 aa35.66■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.66■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.64■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
RAB1A-205ENST00000494188 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 ATP7AQ04656 1500 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.6■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.58■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.58■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.57■■■■□ 3.29
RAB1A-205ENST00000494188 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
RAB1A-205ENST00000494188 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.55■■■■□ 3.28
RAB1A-205ENST00000494188 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.55■■■■□ 3.28
RAB1A-205ENST00000494188 REREQ9P2R6 1566 aa35.53■■■■□ 3.28
RAB1A-205ENST00000494188 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.49■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.49■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 MLECQ14165 292 aa35.47■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 TSPY4P0CV99 314 aa35.46■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 TSPY10P0CW01 314 aa35.46■■■■□ 3.27
RAB1A-205ENST00000494188 MADDQ8WXG6 1647 aa35.43■■■■□ 3.26
RAB1A-205ENST00000494188 A2MP01023 1474 aa35.41■■■■□ 3.26
RAB1A-205ENST00000494188 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.41■■■■□ 3.26
RAB1A-205ENST00000494188 AGLP35573 1532 aa35.41■■■■□ 3.26
RAB1A-205ENST00000494188 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.39■■■■□ 3.26
RAB1A-205ENST00000494188 PLXNC1O60486 1568 aa35.38■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC5O15440 1437 aa35.36■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.36■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 DAPK1P53355 1430 aa35.35■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.33■■■■□ 3.25
RAB1A-205ENST00000494188 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.32■■■■□ 3.24
RAB1A-205ENST00000494188 PTPRMP28827 1452 aa35.3■■■■□ 3.24
RAB1A-205ENST00000494188 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
RAB1A-205ENST00000494188 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.19■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.19■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 KIF15Q9NS87 1388 aa35.17■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 GGT6Q6P531 493 aa35.17■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 KIF3BO15066 747 aa35.15■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.15■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.14■■■■□ 3.22
RAB1A-205ENST00000494188 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
RAB1A-205ENST00000494188 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
RAB1A-205ENST00000494188 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.1■■■■□ 3.21
RAB1A-205ENST00000494188 ADGRL2O95490 1459 aa35.09■■■■□ 3.21
RAB1A-205ENST00000494188 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
RAB1A-205ENST00000494188 ITGAEP38570 1179 aa35.07■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 NCOA1Q15788 1441 aa35.06■■■■□ 3.2
RAB1A-205ENST00000494188 PTPRKQ15262 1439 aa35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms