RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.64■■■□□ 2.18
SYT6-201ENST00000369547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.35■■■□□ 2.13
SYT6-201ENST00000369547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SYT6-201ENST00000369547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.39■■□□□ 1.98
SYT6-201ENST00000369547 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.67■■□□□ 1.86
SYT6-201ENST00000369547 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SYT6-201ENST00000369547 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.91■■□□□ 1.74
SYT6-201ENST00000369547 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SYT6-201ENST00000369547 TRIM41Q8WV44 630 aa25.39■■□□□ 1.65
SYT6-201ENST00000369547 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SYT6-201ENST00000369547 APLP2Q06481 763 aa25.22■■□□□ 1.63
SYT6-201ENST00000369547 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SYT6-201ENST00000369547 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.07■■□□□ 1.6
SYT6-201ENST00000369547 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.98■■□□□ 1.59
SYT6-201ENST00000369547 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SYT6-201ENST00000369547 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYT6-201ENST00000369547 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SYT6-201ENST00000369547 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SYT6-201ENST00000369547 HRCP23327 699 aa24.65■■□□□ 1.54
SYT6-201ENST00000369547 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SYT6-201ENST00000369547 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYT6-201ENST00000369547 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SYT6-201ENST00000369547 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SYT6-201ENST00000369547 ITGAEP38570 1179 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-201ENST00000369547 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYT6-201ENST00000369547 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYT6-201ENST00000369547 ABCC9O60706 1549 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-201ENST00000369547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
SYT6-201ENST00000369547 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SYT6-201ENST00000369547 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SYT6-201ENST00000369547 NEFLP07196 543 aa23.66■■□□□ 1.38
SYT6-201ENST00000369547 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-201ENST00000369547 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-201ENST00000369547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYT6-201ENST00000369547 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYT6-201ENST00000369547 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.41■■□□□ 1.34
SYT6-201ENST00000369547 NEUROD1Q13562 356 aa23.4■■□□□ 1.34
SYT6-201ENST00000369547 SCRIBQ14160 1630 aa23.32■■□□□ 1.32
SYT6-201ENST00000369547 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.31■■□□□ 1.32
SYT6-201ENST00000369547 P3H3Q8IVL6 736 aa23.31■■□□□ 1.32
SYT6-201ENST00000369547 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.3■■□□□ 1.32
SYT6-201ENST00000369547 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.27■■□□□ 1.32
SYT6-201ENST00000369547 TRIM52Q96A61 297 aa23.18■■□□□ 1.3
SYT6-201ENST00000369547 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SYT6-201ENST00000369547 ARID3CA6NKF2 412 aa23.16■■□□□ 1.3
SYT6-201ENST00000369547 BCANQ96GW7 911 aa23.13■■□□□ 1.29
SYT6-201ENST00000369547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-201ENST00000369547 FBLN2P98095 1184 aa23■■□□□ 1.27
SYT6-201ENST00000369547 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SYT6-201ENST00000369547 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYT6-201ENST00000369547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYT6-201ENST00000369547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-201ENST00000369547 ANP32CO43423 234 aa22.83■■□□□ 1.25
SYT6-201ENST00000369547 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SYT6-201ENST00000369547 MYT1Q01538 1121 aa22.77■■□□□ 1.24
SYT6-201ENST00000369547 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SYT6-201ENST00000369547 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SYT6-201ENST00000369547 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SYT6-201ENST00000369547 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYT6-201ENST00000369547 MIER1Q8N108 512 aa22.64■■□□□ 1.22
SYT6-201ENST00000369547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYT6-201ENST00000369547 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-201ENST00000369547 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.58■■□□□ 1.21
SYT6-201ENST00000369547 CLIP1P30622 1438 aa22.56■■□□□ 1.2
SYT6-201ENST00000369547 CEP162Q5TB80 1403 aa22.53■■□□□ 1.2
SYT6-201ENST00000369547 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.5■■□□□ 1.19
SYT6-201ENST00000369547 FKBP8Q14318 412 aa22.49■■□□□ 1.19
SYT6-201ENST00000369547 TONSLQ96HA7 1378 aa22.46■■□□□ 1.19
SYT6-201ENST00000369547 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYT6-201ENST00000369547 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SYT6-201ENST00000369547 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.39■■□□□ 1.17
SYT6-201ENST00000369547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SYT6-201ENST00000369547 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYT6-201ENST00000369547 SOGA1O94964 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.31■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 GOLGA3Q08378 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.28■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.28■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.27■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 BCL11AQ9H165 835 aa22.27■■□□□ 1.16
SYT6-201ENST00000369547 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.25■■□□□ 1.15
SYT6-201ENST00000369547 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYT6-201ENST00000369547 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.22■■□□□ 1.15
SYT6-201ENST00000369547 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SYT6-201ENST00000369547 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-201ENST00000369547 NACADO15069 1562 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-201ENST00000369547 EEA1Q15075 1411 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT6-201ENST00000369547 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT6-201ENST00000369547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYT6-201ENST00000369547 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SYT6-201ENST00000369547 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYT6-201ENST00000369547 MRS2Q9HD23 443 aa22.12■■□□□ 1.13
SYT6-201ENST00000369547 ABCC8Q09428 1581 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-201ENST00000369547 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 TMC1Q8TDI8 760 aa22.05■■□□□ 1.12
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