RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.98■■□□□ 1.75
TMOD1-201ENST00000259365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
TMOD1-201ENST00000259365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMOD1-201ENST00000259365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.3■■□□□ 1.32
TMOD1-201ENST00000259365 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.34■■□□□ 1.17
TMOD1-201ENST00000259365 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD1-201ENST00000259365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.15■■□□□ 1.14
TMOD1-201ENST00000259365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.09■■□□□ 1.13
TMOD1-201ENST00000259365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TMOD1-201ENST00000259365 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD1-201ENST00000259365 HRCP23327 699 aa21.94■■□□□ 1.1
TMOD1-201ENST00000259365 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM41Q8WV44 630 aa21.48■■□□□ 1.03
TMOD1-201ENST00000259365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.34■■□□□ 1.01
TMOD1-201ENST00000259365 SCRIBQ14160 1630 aa21.01■□□□□ 0.95
TMOD1-201ENST00000259365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.01■□□□□ 0.95
TMOD1-201ENST00000259365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
TMOD1-201ENST00000259365 ABCC9O60706 1549 aa20.93■□□□□ 0.94
TMOD1-201ENST00000259365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TMOD1-201ENST00000259365 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMOD1-201ENST00000259365 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
TMOD1-201ENST00000259365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TMOD1-201ENST00000259365 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.68■□□□□ 0.9
TMOD1-201ENST00000259365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.66■□□□□ 0.9
TMOD1-201ENST00000259365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
TMOD1-201ENST00000259365 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TMOD1-201ENST00000259365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
TMOD1-201ENST00000259365 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TMOD1-201ENST00000259365 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TMOD1-201ENST00000259365 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.43■□□□□ 0.86
TMOD1-201ENST00000259365 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TMOD1-201ENST00000259365 NEUROD1Q13562 356 aa20.33■□□□□ 0.84
TMOD1-201ENST00000259365 WIZO95785 1651 aa20.29■□□□□ 0.84
TMOD1-201ENST00000259365 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.26■□□□□ 0.83
TMOD1-201ENST00000259365 APLP2Q06481 763 aa20.22■□□□□ 0.83
TMOD1-201ENST00000259365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.21■□□□□ 0.83
TMOD1-201ENST00000259365 ABCC8Q09428 1581 aa20.2■□□□□ 0.82
TMOD1-201ENST00000259365 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TMOD1-201ENST00000259365 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TMOD1-201ENST00000259365 SOGA1O94964 1423 aa20.17■□□□□ 0.82
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.15■□□□□ 0.82
TMOD1-201ENST00000259365 CEP162Q5TB80 1403 aa20.07■□□□□ 0.8
TMOD1-201ENST00000259365 ITGAEP38570 1179 aa20.05■□□□□ 0.8
TMOD1-201ENST00000259365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.05■□□□□ 0.8
TMOD1-201ENST00000259365 NACADO15069 1562 aa20.03■□□□□ 0.8
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TMOD1-201ENST00000259365 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TMOD1-201ENST00000259365 MIER1Q8N108 512 aa19.94■□□□□ 0.78
TMOD1-201ENST00000259365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TMOD1-201ENST00000259365 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TMOD1-201ENST00000259365 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.83■□□□□ 0.77
TMOD1-201ENST00000259365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
TMOD1-201ENST00000259365 CLIP1P30622 1438 aa19.72■□□□□ 0.75
TMOD1-201ENST00000259365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA3Q08378 1498 aa19.68■□□□□ 0.74
TMOD1-201ENST00000259365 SMARCA2P51531 1590 aa19.67■□□□□ 0.74
TMOD1-201ENST00000259365 SMARCA4P51532 1647 aa19.64■□□□□ 0.74
TMOD1-201ENST00000259365 P3H3Q8IVL6 736 aa19.62■□□□□ 0.73
TMOD1-201ENST00000259365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TMOD1-201ENST00000259365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.54■□□□□ 0.72
TMOD1-201ENST00000259365 EEA1Q15075 1411 aa19.54■□□□□ 0.72
TMOD1-201ENST00000259365 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
TMOD1-201ENST00000259365 BCANQ96GW7 911 aa19.51■□□□□ 0.71
TMOD1-201ENST00000259365 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TMOD1-201ENST00000259365 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.5■□□□□ 0.71
TMOD1-201ENST00000259365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TMOD1-201ENST00000259365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
TMOD1-201ENST00000259365 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.43■□□□□ 0.7
TMOD1-201ENST00000259365 KCNH8Q96L42 1107 aa19.4■□□□□ 0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SYNJ1O43426 1573 aa19.4■□□□□ 0.7
TMOD1-201ENST00000259365 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
TMOD1-201ENST00000259365 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.33■□□□□ 0.69
TMOD1-201ENST00000259365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.32■□□□□ 0.68
TMOD1-201ENST00000259365 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.25■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 ARID3CA6NKF2 412 aa19.22■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 KIF21BO75037 1637 aa19.22■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM52Q96A61 297 aa19.22■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TMOD1-201ENST00000259365 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.19■□□□□ 0.66
TMOD1-201ENST00000259365 FKBP8Q14318 412 aa19.15■□□□□ 0.66
TMOD1-201ENST00000259365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.14■□□□□ 0.65
TMOD1-201ENST00000259365 ARAP1Q96P48 1450 aa19.12■□□□□ 0.65
TMOD1-201ENST00000259365 KIF27Q86VH2 1401 aa19.12■□□□□ 0.65
TMOD1-201ENST00000259365 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.08■□□□□ 0.65
TMOD1-201ENST00000259365 NEFLP07196 543 aa19.05■□□□□ 0.64
TMOD1-201ENST00000259365 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.04■□□□□ 0.64
TMOD1-201ENST00000259365 CUX2O14529 1486 aa19.04■□□□□ 0.64
TMOD1-201ENST00000259365 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
TMOD1-201ENST00000259365 ANP32CO43423 234 aa18.99■□□□□ 0.63
TMOD1-201ENST00000259365 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.98■□□□□ 0.63
TMOD1-201ENST00000259365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.97■□□□□ 0.63
TMOD1-201ENST00000259365 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.97■□□□□ 0.63
TMOD1-201ENST00000259365 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.97■□□□□ 0.63
TMOD1-201ENST00000259365 PRXQ9BXM0 1461 aa18.95■□□□□ 0.62
TMOD1-201ENST00000259365 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms