RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 111.5
TMOD1-201ENST00000259365 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 39.7
TMOD1-201ENST00000259365 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.127e-7■■■■■ 39.4
TMOD1-201ENST00000259365 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 32.5
TMOD1-201ENST00000259365 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.633e-16■■■■■ 31.5
TMOD1-201ENST00000259365 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 30.8
TMOD1-201ENST00000259365 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 28.3
TMOD1-201ENST00000259365 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.9
TMOD1-201ENST00000259365 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 24.4
TMOD1-201ENST00000259365 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 23.8
TMOD1-201ENST00000259365 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.325e-10■■■■□ 23.1
TMOD1-201ENST00000259365 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.563e-8■■■■□ 21.5
TMOD1-201ENST00000259365 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 21.4
TMOD1-201ENST00000259365 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.2
TMOD1-201ENST00000259365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.547e-8■■■■□ 20.3
TMOD1-201ENST00000259365 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 20.1
TMOD1-201ENST00000259365 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 20
TMOD1-201ENST00000259365 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 19.9
TMOD1-201ENST00000259365 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.679e-7■■■□□ 17.8
TMOD1-201ENST00000259365 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.363e-6■■■□□ 16.5
TMOD1-201ENST00000259365 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.057e-8■■■□□ 15.5
TMOD1-201ENST00000259365 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 15.5
TMOD1-201ENST00000259365 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 14.9
TMOD1-201ENST00000259365 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.364e-6■■■□□ 14.8
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.48e-8■■□□□ 13.9
TMOD1-201ENST00000259365 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.513e-7■■□□□ 13.4
TMOD1-201ENST00000259365 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.221e-5■■□□□ 13.3
TMOD1-201ENST00000259365 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 13.3
TMOD1-201ENST00000259365 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.345e-9■■□□□ 13
TMOD1-201ENST00000259365 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.076e-6■■□□□ 12.7
TMOD1-201ENST00000259365 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.081e-10■■□□□ 12.2
TMOD1-201ENST00000259365 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 11.2
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 10.8
TMOD1-201ENST00000259365 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.043e-13■□□□□ 10.7
TMOD1-201ENST00000259365 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.159e-8■□□□□ 10.3
TMOD1-201ENST00000259365 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.011e-8■□□□□ 10.2
TMOD1-201ENST00000259365 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.227e-7■□□□□ 9.9
TMOD1-201ENST00000259365 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.496e-6■□□□□ 9.5
TMOD1-201ENST00000259365 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.335e-7■□□□□ 9.4
TMOD1-201ENST00000259365 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 9.3
TMOD1-201ENST00000259365 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.075e-10■□□□□ 8.6
TMOD1-201ENST00000259365 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.372e-8■□□□□ 8.4
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