RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000206570.1

Ppp4c-211, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ppp4c, Length 1,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55.44■■■■■ 6.47
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NischQ80TM9 1593 aa54.66■■■■■ 6.34
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Abcc9P70170 1546 aa52.89■■■■■ 6.06
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Abcc8B2RUS7 1588 aa52.87■■■■■ 6.05
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 ScribQ80U72 1612 aa51.13■■■■■ 5.78
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NacadQ5SWP3 1504 aa49.4■■■■■ 5.5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kdm5dQ62240 1548 aa49.39■■■■■ 5.5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48.54■■■■■ 5.36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48.45■■■■■ 5.35
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 BicraF8VPZ9 1578 aa47.86■■■■■ 5.25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47.67■■■■■ 5.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rhox8Q6VSS7 320 aa47.13■■■■■ 5.13
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Baz1aO88379 1555 aa46.94■■■■■ 5.11
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46.85■■■■■ 5.09
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46.71■■■■■ 5.07
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46.66■■■■■ 5.06
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.98
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45.57■■■■■ 4.88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.52■■■■■ 4.88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45.51■■■■■ 4.88
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45.46■■■■■ 4.87
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45.41■■■■■ 4.86
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fam135aQ6NS59 1506 aa45.09■■■■■ 4.81
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45.03■■■■■ 4.8
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44.97■■■■■ 4.79
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rtl1Q7M732 1744 aa44.79■■■■■ 4.76
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44.45■■■■■ 4.71
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Baz1bQ9Z277 1479 aa44.4■■■■■ 4.7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 CftrP26361 1476 aa44.39■■■■■ 4.7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44.39■■■■■ 4.7
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Synj1Q8CHC4 1574 aa44.36■■■■■ 4.69
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44.3■■■■■ 4.68
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44.14■■■■■ 4.66
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Mrc2Q64449 1479 aa44.03■■■■■ 4.64
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Trim41Q5NCC3 630 aa43.34■■■■■ 4.53
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kif15Q6P9L6 1387 aa43.32■■■■■ 4.52
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cux2P70298 1426 aa43.31■■■■■ 4.52
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43.15■■■■■ 4.5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43.14■■■■■ 4.5
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43.1■■■■■ 4.49
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Top2bQ64511 1612 aa42.68■■■■■ 4.42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cep164Q5DU05 1446 aa42.67■■■■■ 4.42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Golga3P55937 1487 aa42.65■■■■■ 4.42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 TnnQ80Z71 1560 aa42.65■■■■■ 4.42
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cngb1E1AZ71 1325 aa42.53■■■■■ 4.4
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc18Q640L5 1455 aa42.47■■■■■ 4.39
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Il27Q8K3I6 234 aa42.46■■■■■ 4.39
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Camsap1A2AHC3 1581 aa42.39■■■■■ 4.38
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Dnajc5P60904 198 aa42.29■■■■■ 4.36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Plb1Q3TTY0 1478 aa42.29■■■■■ 4.36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Crocc2F6XLV1 1638 aa42.23■■■■■ 4.35
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fmn1Q05860 1466 aa42.19■■■■■ 4.34
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Shroom2A2ALU4 1481 aa41.97■■■■■ 4.31
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ift140E9PY46 1464 aa41.87■■■■■ 4.29
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Duox2A2AQ99 1517 aa41.85■■■■■ 4.29
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rusc2Q80U22 1514 aa41.8■■■■■ 4.28
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Grin2bQ01097 1482 aa41.77■■■■■ 4.28
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Disp1Q3TDN0 1521 aa41.58■■■■■ 4.25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Samd9lQ69Z37 1561 aa41.58■■■■■ 4.25
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41.54■■■■■ 4.24
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41.44■■■■■ 4.23
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Col17a1Q07563 1470 aa41.43■■■■■ 4.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Efcab5A0JP43 1406 aa41.43■■■■■ 4.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41.29■■■■■ 4.2
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41.29■■■■■ 4.2
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 NrkQ9R0G8 1455 aa41.24■■■■■ 4.19
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Chic1Q8CBW7 227 aa41.2■■■■■ 4.19
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Grin2aP35436 1464 aa41.17■■■■■ 4.18
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41.17■■■■■ 4.18
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 PtprkP35822 1457 aa41.09■■■■■ 4.17
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Shroom4Q1W617 1475 aa41.08■■■■■ 4.17
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 SynmQ70IV5 1561 aa40.93■■■■■ 4.14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Pla2r1Q62028 1487 aa40.92■■■■■ 4.14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40.89■■■■■ 4.14
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gpatch8A2A6A1 1505 aa40.86■■■■■ 4.13
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Zeb1Q64318 1117 aa40.74■■■■■ 4.11
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 AknaQ80VW7 1404 aa40.68■■■■■ 4.1
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Cep170Q6A065 1588 aa40.65■■■■■ 4.1
Ppp4c-211ENSMUST00000206570 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms