RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000205287.1

Tsen34-211, Transcript of tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Tsen34, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Gm35339	A0A140LHH9	1649 aa		53.99	■■■■■ 6.23
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Nisch	Q80TM9	1593 aa		53.35	■■■■■ 6.13
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		51.64	■■■■■ 5.86
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Abcc9	P70170	1546 aa		51.62	■■■■■ 5.85
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Scrib	Q80U72	1612 aa		49.73	■■■■■ 5.55
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		48.27	■■■■■ 5.32
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Kdm5d	Q62240	1548 aa		48.13	■■■■■ 5.3
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Dcaf1	Q80TR8	1506 aa		47.54	■■■■■ 5.2
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Sycp2	Q9CUU3	1500 aa		47.33	■■■■■ 5.17
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Bicra	F8VPZ9	1578 aa		46.62	■■■■■ 5.05
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		46.44	■■■■■ 5.03
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rhox8	Q6VSS7	320 aa		46.07	■■■■■ 4.97
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Baz1a	O88379	1555 aa		45.83	■■■■■ 4.93
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Crybg2	B7ZCC2	1516 aa		45.78	■■■■■ 4.92
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ccdc180	J3QNE4	1664 aa		45.7	■■■■■ 4.91
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Dnajc5b	Q9CQ94	199 aa		45.52	■■■■■ 4.88
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pds5b	Q4VA53	1446 aa	Known RBP	45.43	■■■■■ 4.86
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Zcchc6	Q5BLK4	1491 aa	Known RBP	45.19	■■■■■ 4.82
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Atad2b	E9Q166	1460 aa	Known RBP	44.98	■■■■■ 4.79
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Thoc2	B1AZI6	1594 aa	Known RBP	44.96	■■■■■ 4.79
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Smarca4	Q3TKT4	1613 aa	Known RBP	44.5	■■■■■ 4.71
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Smarca2	Q6DIC0	1577 aa		44.48	■■■■■ 4.71
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cecr2	E9Q2Z1	1453 aa		44.42	■■■■■ 4.7
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ercc6	F8VPZ5	1481 aa		44.41	■■■■■ 4.7
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Iqgap2	Q3UQ44	1575 aa		44.26	■■■■■ 4.68
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cc2d2a	Q8CFW7	1633 aa		44.21	■■■■■ 4.67
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Fam135a	Q6NS59	1506 aa		43.97	■■■■■ 4.63
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Wdr62	Q3U3T8	1523 aa		43.93	■■■■■ 4.62
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Frmpd1	A2AKB4	1549 aa		43.9	■■■■■ 4.62
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Phldb1	Q6PDH0	1371 aa	Known RBP	43.74	■■■■■ 4.59
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Baz1b	Q9Z277	1479 aa		43.57	■■■■■ 4.57
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cftr	P26361	1476 aa		43.44	■■■■■ 4.54
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rtl1	Q7M732	1744 aa		43.41	■■■■■ 4.54
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ubl4b	Q9CQ84	188 aa		43.32	■■■■■ 4.53
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cttnbp2	B9EJA2	1648 aa		43.24	■■■■■ 4.51
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Synj1	Q8CHC4	1574 aa		43.23	■■■■■ 4.51
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ccdc136	Q3TVA9	1136 aa		43.15	■■■■■ 4.5
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Unc13a	Q4KUS2	1712 aa		43.02	■■■■■ 4.48
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Mrc2	Q64449	1479 aa		42.97	■■■■■ 4.47
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Esf1	Q3V1V3	845 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Trim41	Q5NCC3	630 aa		42.55	■■■■■ 4.4
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rsf1	E9PWW9	1441 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Kif15	Q6P9L6	1387 aa		42.34	■■■■■ 4.37
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cux2	P70298	1426 aa		42.33	■■■■■ 4.37
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Lamc3	Q9R0B6	1581 aa		42.11	■■■■■ 4.33
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Npm1	Q61937	292 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Lrriq1	Q0P5X1	1673 aa		41.9	■■■■■ 4.3
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Kif21a	Q9QXL2	1672 aa		41.83	■■■■■ 4.29
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Golga3	P55937	1487 aa		41.74	■■■■■ 4.27
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cep164	Q5DU05	1446 aa		41.74	■■■■■ 4.27
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Top2b	Q64511	1612 aa		41.59	■■■■■ 4.25
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Tnn	Q80Z71	1560 aa		41.59	■■■■■ 4.25
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ccdc18	Q640L5	1455 aa		41.54	■■■■■ 4.24
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cngb1	E1AZ71	1325 aa		41.53	■■■■■ 4.24
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Dhx29	Q6PGC1	1365 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.23
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Il27	Q8K3I6	234 aa		41.42	■■■■■ 4.22
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Lrpprc	Q6PB66	1392 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Eif4g3	Q80XI3	1579 aa	Known RBP	41.35	■■■■■ 4.21
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Camsap1	A2AHC3	1581 aa		41.32	■■■■■ 4.21
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Urb2	E9Q7L1	1524 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.21
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Plb1	Q3TTY0	1478 aa		41.3	■■■■■ 4.2
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Fmn1	Q05860	1466 aa		41.28	■■■■■ 4.2
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Dnajc5	P60904	198 aa		41.27	■■■■■ 4.2
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pogz	Q8BZH4	1409 aa	Known RBP	41.12	■■■■■ 4.17
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Crocc2	F6XLV1	1638 aa		41.11	■■■■■ 4.17
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Shroom2	A2ALU4	1481 aa		40.99	■■■■■ 4.15
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ift140	E9PY46	1464 aa		40.94	■■■■■ 4.14
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Duox2	A2AQ99	1517 aa		40.9	■■■■■ 4.14
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Grin2b	Q01097	1482 aa		40.83	■■■■■ 4.13
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rusc2	Q80U22	1514 aa		40.73	■■■■■ 4.11
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Disp1	Q3TDN0	1521 aa		40.65	■■■■■ 4.1
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Efcab5	A0JP43	1406 aa		40.64	■■■■■ 4.1
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pabpn1	Q8CCS6	302 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ccdc88b	Q4QRL3	1481 aa		40.58	■■■■■ 4.09
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Samd9l	Q69Z37	1561 aa		40.49	■■■■■ 4.07
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Nup160	Q9Z0W3	1402 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Cc2d2b	A0A286YDU8	1405 aa		40.44	■■■■■ 4.06
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Top2a	Q01320	1528 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Col17a1	Q07563	1470 aa		40.41	■■■■■ 4.06
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Nrk	Q9R0G8	1455 aa		40.39	■■■■■ 4.06
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pbrm1	Q8BSQ9	1634 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Chic1	Q8CBW7	227 aa		40.32	■■■■■ 4.04
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pelp1	Q9DBD5	1123 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Rad54l2	Q99NG0	1466 aa		40.28	■■■■■ 4.04
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Grin2a	P35436	1464 aa		40.19	■■■■■ 4.02
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Magi3	Q9EQJ9	1476 aa		40.17	■■■■■ 4.02
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Shroom4	Q1W617	1475 aa		40.16	■■■■■ 4.02
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Ptprk	P35822	1457 aa		40.13	■■■■■ 4.02
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Aqr	Q8CFQ3	1481 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Setd1b	Q8CFT2	1985 aa		40.08	■■■■■ 4.01
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Fgd6	Q69ZL1	1399 aa		40.02	■■■■■ 4
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Zcchc11	B2RX14	1644 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Pla2r1	Q62028	1487 aa		39.93	■■■■□ 3.98
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Synm	Q70IV5	1561 aa		39.93	■■■■□ 3.98
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Gpatch8	A2A6A1	1505 aa		39.91	■■■■□ 3.98
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Zeb1	Q64318	1117 aa		39.79	■■■■□ 3.96
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Akna	Q80VW7	1404 aa		39.65	■■■■□ 3.94
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Gapvd1	Q6PAR5	1458 aa		39.64	■■■■□ 3.94
Tsen34-211	ENSMUST00000205287	Mroh2b	Q7M6Y6	1581 aa		39.63	■■■■□ 3.93

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