RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000183031.1

Gm27017-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm27017, Length 656 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa29.91■■■□□ 2.38
Gm27017-201ENSMUST00000183031 NischQ80TM9 1593 aa29.18■■■□□ 2.26
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Abcc8B2RUS7 1588 aa28.33■■■□□ 2.13
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Abcc9P70170 1546 aa28.29■■■□□ 2.12
Gm27017-201ENSMUST00000183031 ScribQ80U72 1612 aa27.59■■■□□ 2.01
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Kdm5dQ62240 1548 aa26.48■■□□□ 1.83
Gm27017-201ENSMUST00000183031 NacadQ5SWP3 1504 aa26.47■■□□□ 1.83
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Dcaf1Q80TR8 1506 aa26.07■■□□□ 1.76
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.01■■□□□ 1.75
Gm27017-201ENSMUST00000183031 BicraF8VPZ9 1578 aa25.8■■□□□ 1.72
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.43■■□□□ 1.66
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa25.23■■□□□ 1.63
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ccdc180J3QNE4 1664 aa25.2■■□□□ 1.62
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Baz1aO88379 1555 aa25.05■■□□□ 1.6
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.99■■□□□ 1.59
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.61■■□□□ 1.53
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.48■■□□□ 1.51
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.42■■□□□ 1.5
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.33■■□□□ 1.49
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.32■■□□□ 1.48
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.31■■□□□ 1.48
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Fam135aQ6NS59 1506 aa24.3■■□□□ 1.48
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.18■■□□□ 1.46
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.13■■□□□ 1.45
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Unc13aQ4KUS2 1712 aa24.06■■□□□ 1.44
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.93■■□□□ 1.42
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rtl1Q7M732 1744 aa23.87■■□□□ 1.41
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.73■■□□□ 1.39
Gm27017-201ENSMUST00000183031 CftrP26361 1476 aa23.68■■□□□ 1.38
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.67■■□□□ 1.38
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Mrc2Q64449 1479 aa23.61■■□□□ 1.37
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa23.25■■□□□ 1.31
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Kif21aQ9QXL2 1672 aa23.16■■□□□ 1.3
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.14■■□□□ 1.29
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Lamc3Q9R0B6 1581 aa23.1■■□□□ 1.29
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cux2P70298 1426 aa23.09■■□□□ 1.29
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.01■■□□□ 1.27
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Dnajc5P60904 198 aa22.93■■□□□ 1.26
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Gm27017-201ENSMUST00000183031 TnnQ80Z71 1560 aa22.86■■□□□ 1.25
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Top2bQ64511 1612 aa22.82■■□□□ 1.24
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Trim41Q5NCC3 630 aa22.8■■□□□ 1.24
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cep164Q5DU05 1446 aa22.68■■□□□ 1.22
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.66■■□□□ 1.22
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.66■■□□□ 1.22
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Golga3P55937 1487 aa22.6■■□□□ 1.21
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.6■■□□□ 1.21
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.59■■□□□ 1.21
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.54■■□□□ 1.2
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.52■■□□□ 1.2
Gm27017-201ENSMUST00000183031 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rusc2Q80U22 1514 aa22.43■■□□□ 1.18
Gm27017-201ENSMUST00000183031 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Fmn1Q05860 1466 aa22.4■■□□□ 1.18
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Col17a1Q07563 1470 aa22.39■■□□□ 1.17
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ift140E9PY46 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Il27Q8K3I6 234 aa22.36■■□□□ 1.17
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Duox2A2AQ99 1517 aa22.31■■□□□ 1.16
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Grin2bQ01097 1482 aa22.27■■□□□ 1.16
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Samd9lQ69Z37 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.26■■□□□ 1.15
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.25■■□□□ 1.15
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Efcab5A0JP43 1406 aa22.07■■□□□ 1.12
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Gpatch8A2A6A1 1505 aa22.05■■□□□ 1.12
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.05■■□□□ 1.12
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.03■■□□□ 1.12
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22■■□□□ 1.11
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.98■■□□□ 1.11
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Grin2aP35436 1464 aa21.97■■□□□ 1.11
Gm27017-201ENSMUST00000183031 NrkQ9R0G8 1455 aa21.96■■□□□ 1.11
Gm27017-201ENSMUST00000183031 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Gm27017-201ENSMUST00000183031 PtprkP35822 1457 aa21.88■■□□□ 1.09
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Pla2r1Q62028 1487 aa21.87■■□□□ 1.09
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Shroom4Q1W617 1475 aa21.84■■□□□ 1.09
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Cep170Q6A065 1588 aa21.83■■□□□ 1.09
Gm27017-201ENSMUST00000183031 SynmQ70IV5 1561 aa21.83■■□□□ 1.09
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Chd1P40201 1711 aa21.83■■□□□ 1.08
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.81■■□□□ 1.08
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.8■■□□□ 1.08
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.75■■□□□ 1.07
Gm27017-201ENSMUST00000183031 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.4 ms