RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176515.1

Chtf8-205, Transcript of Chromosome transmission fidelity protein 8 homolog isoform 2, mouse

TSL 2 BASIC

Gene Chtf8, Length 694 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Gm35339	A0A140LHH9	1649 aa		54.14	■■■■■ 6.26
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Nisch	Q80TM9	1593 aa		53.24	■■■■■ 6.11
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		51.67	■■■■■ 5.86
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Abcc9	P70170	1546 aa		51.44	■■■■■ 5.83
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Scrib	Q80U72	1612 aa		50.16	■■■■■ 5.62
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		48.54	■■■■■ 5.36
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Kdm5d	Q62240	1548 aa		48.39	■■■■■ 5.34
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Sycp2	Q9CUU3	1500 aa		47.62	■■■■■ 5.21
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Dcaf1	Q80TR8	1506 aa		47.36	■■■■■ 5.17
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Bicra	F8VPZ9	1578 aa		47.05	■■■■■ 5.12
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Dnajc5b	Q9CQ94	199 aa		46.78	■■■■■ 5.08
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		46.33	■■■■■ 5.01
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pds5b	Q4VA53	1446 aa	Known RBP	45.91	■■■■■ 4.94
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Thoc2	B1AZI6	1594 aa	Known RBP	45.71	■■■■■ 4.91
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Baz1a	O88379	1555 aa		45.64	■■■■■ 4.9
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Crybg2	B7ZCC2	1516 aa		45.59	■■■■■ 4.89
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rhox8	Q6VSS7	320 aa		45.46	■■■■■ 4.87
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ccdc180	J3QNE4	1664 aa		45.42	■■■■■ 4.86
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Atad2b	E9Q166	1460 aa	Known RBP	45.34	■■■■■ 4.85
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Zcchc6	Q5BLK4	1491 aa	Known RBP	45.14	■■■■■ 4.82
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cc2d2a	Q8CFW7	1633 aa		44.95	■■■■■ 4.79
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ercc6	F8VPZ5	1481 aa		44.9	■■■■■ 4.78
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Smarca2	Q6DIC0	1577 aa		44.73	■■■■■ 4.75
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Smarca4	Q3TKT4	1613 aa	Known RBP	44.67	■■■■■ 4.74
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Fam135a	Q6NS59	1506 aa		44.55	■■■■■ 4.72
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Iqgap2	Q3UQ44	1575 aa		44.53	■■■■■ 4.72
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cecr2	E9Q2Z1	1453 aa		44.42	■■■■■ 4.7
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Wdr62	Q3U3T8	1523 aa		44.26	■■■■■ 4.68
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Frmpd1	A2AKB4	1549 aa		44.23	■■■■■ 4.67
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Phldb1	Q6PDH0	1371 aa	Known RBP	44.17	■■■■■ 4.66
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Baz1b	Q9Z277	1479 aa		44.03	■■■■■ 4.64
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ubl4b	Q9CQ84	188 aa		43.82	■■■■■ 4.61
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Mrc2	Q64449	1479 aa		43.54	■■■■■ 4.56
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Unc13a	Q4KUS2	1712 aa		43.45	■■■■■ 4.55
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cftr	P26361	1476 aa		43.29	■■■■■ 4.52
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cttnbp2	B9EJA2	1648 aa		43.18	■■■■■ 4.5
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Synj1	Q8CHC4	1574 aa		43.09	■■■■■ 4.49
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Dnajc5	P60904	198 aa		42.95	■■■■■ 4.47
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Trim41	Q5NCC3	630 aa		42.82	■■■■■ 4.45
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rtl1	Q7M732	1744 aa		42.82	■■■■■ 4.44
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ccdc136	Q3TVA9	1136 aa		42.68	■■■■■ 4.42
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cux2	P70298	1426 aa		42.58	■■■■■ 4.41
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Lrriq1	Q0P5X1	1673 aa		42.57	■■■■■ 4.4
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Esf1	Q3V1V3	845 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rsf1	E9PWW9	1441 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Kif15	Q6P9L6	1387 aa		42.47	■■■■■ 4.39
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Kif21a	Q9QXL2	1672 aa		42.3	■■■■■ 4.36
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Lamc3	Q9R0B6	1581 aa		42.14	■■■■■ 4.34
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Npm1	Q61937	292 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Eif4g3	Q80XI3	1579 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cep164	Q5DU05	1446 aa		41.9	■■■■■ 4.3
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Shroom2	A2ALU4	1481 aa		41.87	■■■■■ 4.29
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Urb2	E9Q7L1	1524 aa	Known RBP	41.69	■■■■■ 4.26
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Dhx29	Q6PGC1	1365 aa	Known RBP	41.64	■■■■■ 4.26
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Plb1	Q3TTY0	1478 aa		41.62	■■■■■ 4.25
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ccdc18	Q640L5	1455 aa		41.55	■■■■■ 4.24
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Il27	Q8K3I6	234 aa		41.54	■■■■■ 4.24
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Lrpprc	Q6PB66	1392 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Tnn	Q80Z71	1560 aa		41.45	■■■■■ 4.23
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Col17a1	Q07563	1470 aa		41.42	■■■■■ 4.22
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pabpn1	Q8CCS6	302 aa	Known RBP	41.38	■■■■■ 4.21
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Crocc2	F6XLV1	1638 aa		41.36	■■■■■ 4.21
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Camsap1	A2AHC3	1581 aa		41.3	■■■■■ 4.2
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Golga3	P55937	1487 aa		41.26	■■■■■ 4.2
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Top2b	Q64511	1612 aa		41.24	■■■■■ 4.19
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ift140	E9PY46	1464 aa		41.2	■■■■■ 4.19
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rusc2	Q80U22	1514 aa		41.16	■■■■■ 4.18
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pogz	Q8BZH4	1409 aa	Known RBP	41.16	■■■■■ 4.18
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cngb1	E1AZ71	1325 aa		41.13	■■■■■ 4.17
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pelp1	Q9DBD5	1123 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Duox2	A2AQ99	1517 aa		40.94	■■■■■ 4.14
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Fmn1	Q05860	1466 aa		40.91	■■■■■ 4.14
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Disp1	Q3TDN0	1521 aa		40.83	■■■■■ 4.13
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Zcchc11	B2RX14	1644 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Grin2b	Q01097	1482 aa		40.72	■■■■■ 4.11
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Nup160	Q9Z0W3	1402 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cc2d2b	A0A286YDU8	1405 aa		40.64	■■■■■ 4.1
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Samd9l	Q69Z37	1561 aa		40.57	■■■■■ 4.09
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pbrm1	Q8BSQ9	1634 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Efcab5	A0JP43	1406 aa		40.51	■■■■■ 4.08
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Setd1b	Q8CFT2	1985 aa		40.44	■■■■■ 4.06
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Rad54l2	Q99NG0	1466 aa		40.36	■■■■■ 4.05
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Adgrl3	Q80TS3	1537 aa		40.35	■■■■■ 4.05
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Fgd6	Q69ZL1	1399 aa		40.32	■■■■■ 4.04
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Aqr	Q8CFQ3	1481 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Grin2a	P35436	1464 aa		40.3	■■■■■ 4.04
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ptprk	P35822	1457 aa		40.28	■■■■■ 4.04
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Magi3	Q9EQJ9	1476 aa		40.25	■■■■■ 4.03
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Pcdh10	E9PXQ7	1057 aa		40.21	■■■■■ 4.03
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Arhgef5	E9Q7D5	1581 aa		40.2	■■■■■ 4.03
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Gapvd1	Q6PAR5	1458 aa		40.19	■■■■■ 4.03
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Cep170	Q6A065	1588 aa		40.18	■■■■■ 4.02
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Gm156	Q58A37	223 aa		40.17	■■■■■ 4.02
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ttbk1	Q6PCN3	1308 aa		40.14	■■■■■ 4.02
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Nrk	Q9R0G8	1455 aa		40.11	■■■■■ 4.01
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ptprt	Q99M80	1454 aa		40.02	■■■■■ 4
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Akna	Q80VW7	1404 aa		40.01	■■■■■ 4
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Ccdc88b	Q4QRL3	1481 aa		40	■■■■□ 3.99
Chtf8-205	ENSMUST00000176515	Top2a	Q01320	1528 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.8 ms