RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176304.7

Syne4-208, Transcript of Nesprin-4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Syne4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa37.22■■■■□ 3.55
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Abcc9P70170 1546 aa35.39■■■■□ 3.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 ScribQ80U72 1612 aa34.47■■■■□ 3.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 NacadQ5SWP3 1504 aa33.24■■■□□ 2.91
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kdm5dQ62240 1548 aa33.23■■■□□ 2.91
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sycp2Q9CUU3 1500 aa32.62■■■□□ 2.81
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.52■■■□□ 2.8
Syne4-208ENSMUST00000176304 BicraF8VPZ9 1578 aa32.28■■■□□ 2.76
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.9■■■□□ 2.7
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.89■■■□□ 2.7
Syne4-208ENSMUST00000176304 Baz1aO88379 1555 aa31.39■■■□□ 2.61
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.33■■■□□ 2.61
Syne4-208ENSMUST00000176304 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.27■■■□□ 2.6
Syne4-208ENSMUST00000176304 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.2■■■□□ 2.59
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.8■■■□□ 2.52
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.74■■■□□ 2.51
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.66■■■□□ 2.5
Syne4-208ENSMUST00000176304 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa30.57■■■□□ 2.48
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa30.52■■■□□ 2.48
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.49■■■□□ 2.47
Syne4-208ENSMUST00000176304 Wdr62Q3U3T8 1523 aa30.34■■■□□ 2.45
Syne4-208ENSMUST00000176304 Frmpd1A2AKB4 1549 aa30.29■■■□□ 2.44
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.98■■■□□ 2.39
Syne4-208ENSMUST00000176304 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.97■■■□□ 2.39
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.91■■■□□ 2.38
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mrc2Q64449 1479 aa29.77■■■□□ 2.36
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rtl1Q7M732 1744 aa29.73■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.72■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 CftrP26361 1476 aa29.72■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.69■■■□□ 2.34
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.38■■■□□ 2.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Trim41Q5NCC3 630 aa29.22■■■□□ 2.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.21■■■□□ 2.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cux2P70298 1426 aa29.16■■■□□ 2.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif15Q6P9L6 1387 aa29.11■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dnajc5P60904 198 aa29.09■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.09■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.93■■■□□ 2.22
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cep164Q5DU05 1446 aa28.68■■■□□ 2.18
Syne4-208ENSMUST00000176304 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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Syne4-208ENSMUST00000176304 TnnQ80Z71 1560 aa28.53■■■□□ 2.16
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Syne4-208ENSMUST00000176304 Il27Q8K3I6 234 aa28.51■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc18Q640L5 1455 aa28.48■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Top2bQ64511 1612 aa28.45■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Crocc2F6XLV1 1638 aa28.41■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.41■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Golga3P55937 1487 aa28.39■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.34■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Col17a1Q07563 1470 aa28.23■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rusc2Q80U22 1514 aa28.21■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ift140E9PY46 1464 aa28.19■■■□□ 2.1
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Fmn1Q05860 1466 aa28.12■■■□□ 2.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Duox2A2AQ99 1517 aa28.08■■■□□ 2.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Grin2bQ01097 1482 aa27.96■■■□□ 2.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.93■■■□□ 2.06
Syne4-208ENSMUST00000176304 Setd1bQ8CFT2 1985 aa27.93■■■□□ 2.06
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Syne4-208ENSMUST00000176304 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa27.78■■■□□ 2.04
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Syne4-208ENSMUST00000176304 PtprkP35822 1457 aa27.51■■■□□ 2
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Syne4-208ENSMUST00000176304 SynmQ70IV5 1561 aa27.4■■□□□ 1.98
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