RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176304.7

Syne4-208, Transcript of Nesprin-4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Syne4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa37.22■■■■□ 3.55
Syne4-208ENSMUST00000176304 NischQ80TM9 1593 aa36.6■■■■□ 3.45
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abcc8B2RUS7 1588 aa35.47■■■■□ 3.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abcc9P70170 1546 aa35.39■■■■□ 3.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 ScribQ80U72 1612 aa34.47■■■■□ 3.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 NacadQ5SWP3 1504 aa33.24■■■□□ 2.91
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kdm5dQ62240 1548 aa33.23■■■□□ 2.91
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sycp2Q9CUU3 1500 aa32.62■■■□□ 2.81
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.52■■■□□ 2.8
Syne4-208ENSMUST00000176304 BicraF8VPZ9 1578 aa32.28■■■□□ 2.76
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.9■■■□□ 2.7
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.89■■■□□ 2.7
Syne4-208ENSMUST00000176304 Baz1aO88379 1555 aa31.39■■■□□ 2.61
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.33■■■□□ 2.61
Syne4-208ENSMUST00000176304 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.27■■■□□ 2.6
Syne4-208ENSMUST00000176304 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.2■■■□□ 2.59
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
Syne4-208ENSMUST00000176304 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.8■■■□□ 2.52
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.74■■■□□ 2.51
Syne4-208ENSMUST00000176304 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
Syne4-208ENSMUST00000176304 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.66■■■□□ 2.5
Syne4-208ENSMUST00000176304 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa30.57■■■□□ 2.48
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa30.52■■■□□ 2.48
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.49■■■□□ 2.47
Syne4-208ENSMUST00000176304 Wdr62Q3U3T8 1523 aa30.34■■■□□ 2.45
Syne4-208ENSMUST00000176304 Frmpd1A2AKB4 1549 aa30.29■■■□□ 2.44
Syne4-208ENSMUST00000176304 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Syne4-208ENSMUST00000176304 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.98■■■□□ 2.39
Syne4-208ENSMUST00000176304 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.97■■■□□ 2.39
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.91■■■□□ 2.38
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mrc2Q64449 1479 aa29.77■■■□□ 2.36
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rtl1Q7M732 1744 aa29.73■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.72■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 CftrP26361 1476 aa29.72■■■□□ 2.35
Syne4-208ENSMUST00000176304 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.69■■■□□ 2.34
Syne4-208ENSMUST00000176304 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.38■■■□□ 2.29
Syne4-208ENSMUST00000176304 Trim41Q5NCC3 630 aa29.22■■■□□ 2.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.21■■■□□ 2.27
Syne4-208ENSMUST00000176304 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cux2P70298 1426 aa29.16■■■□□ 2.26
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif15Q6P9L6 1387 aa29.11■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dnajc5P60904 198 aa29.09■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.09■■■□□ 2.25
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.93■■■□□ 2.22
Syne4-208ENSMUST00000176304 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cep164Q5DU05 1446 aa28.68■■■□□ 2.18
Syne4-208ENSMUST00000176304 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Syne4-208ENSMUST00000176304 Shroom2A2ALU4 1481 aa28.53■■■□□ 2.16
Syne4-208ENSMUST00000176304 TnnQ80Z71 1560 aa28.53■■■□□ 2.16
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Syne4-208ENSMUST00000176304 Il27Q8K3I6 234 aa28.51■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc18Q640L5 1455 aa28.48■■■□□ 2.15
Syne4-208ENSMUST00000176304 Top2bQ64511 1612 aa28.45■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Crocc2F6XLV1 1638 aa28.41■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.41■■■□□ 2.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Golga3P55937 1487 aa28.39■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.34■■■□□ 2.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Col17a1Q07563 1470 aa28.23■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rusc2Q80U22 1514 aa28.21■■■□□ 2.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ift140E9PY46 1464 aa28.19■■■□□ 2.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fmn1Q05860 1466 aa28.12■■■□□ 2.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Duox2A2AQ99 1517 aa28.08■■■□□ 2.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Disp1Q3TDN0 1521 aa27.97■■■□□ 2.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Grin2bQ01097 1482 aa27.96■■■□□ 2.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.93■■■□□ 2.06
Syne4-208ENSMUST00000176304 Setd1bQ8CFT2 1985 aa27.93■■■□□ 2.06
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
Syne4-208ENSMUST00000176304 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa27.78■■■□□ 2.04
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.73■■■□□ 2.03
Syne4-208ENSMUST00000176304 Efcab5A0JP43 1406 aa27.73■■■□□ 2.03
Syne4-208ENSMUST00000176304 Grin2aP35436 1464 aa27.64■■■□□ 2.02
Syne4-208ENSMUST00000176304 Magi3Q9EQJ9 1476 aa27.64■■■□□ 2.01
Syne4-208ENSMUST00000176304 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.6■■■□□ 2.01
Syne4-208ENSMUST00000176304 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.57■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fgd6Q69ZL1 1399 aa27.56■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cep170Q6A065 1588 aa27.52■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 NrkQ9R0G8 1455 aa27.52■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 PtprkP35822 1457 aa27.51■■■□□ 2
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
Syne4-208ENSMUST00000176304 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.47■■□□□ 1.99
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pla2r1Q62028 1487 aa27.44■■□□□ 1.98
Syne4-208ENSMUST00000176304 Shroom4Q1W617 1475 aa27.44■■□□□ 1.98
Syne4-208ENSMUST00000176304 AknaQ80VW7 1404 aa27.42■■□□□ 1.98
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa27.41■■□□□ 1.98
Syne4-208ENSMUST00000176304 SynmQ70IV5 1561 aa27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.3 ms