RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172746.7

Gm20482-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20482, Length 1,644 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.63■■■□□ 2.81
Gm20482-201ENSMUST00000172746 NischQ80TM9 1593 aa32.36■■■□□ 2.77
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Abcc9P70170 1546 aa31.34■■■□□ 2.61
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Abcc8B2RUS7 1588 aa31.19■■■□□ 2.58
Gm20482-201ENSMUST00000172746 ScribQ80U72 1612 aa29.9■■■□□ 2.38
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Kdm5dQ62240 1548 aa28.96■■■□□ 2.23
Gm20482-201ENSMUST00000172746 NacadQ5SWP3 1504 aa28.93■■■□□ 2.22
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.76■■■□□ 2.19
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28.37■■■□□ 2.13
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.3■■■□□ 2.12
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.23■■■□□ 2.11
Gm20482-201ENSMUST00000172746 BicraF8VPZ9 1578 aa27.98■■■□□ 2.07
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ccdc180J3QNE4 1664 aa27.87■■■□□ 2.05
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Baz1aO88379 1555 aa27.85■■■□□ 2.05
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.67■■■□□ 2.02
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Smarca2Q6DIC0 1577 aa27.08■■□□□ 1.93
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rtl1Q7M732 1744 aa26.97■■□□□ 1.91
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.91■■□□□ 1.9
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa26.73■■□□□ 1.87
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa26.61■■□□□ 1.85
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.49■■□□□ 1.83
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ercc6F8VPZ5 1481 aa26.42■■□□□ 1.82
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.32■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Frmpd1A2AKB4 1549 aa26.31■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Wdr62Q3U3T8 1523 aa26.31■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 CftrP26361 1476 aa26.31■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.31■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.24■■□□□ 1.79
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.13■■□□□ 1.77
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.04■■□□□ 1.76
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Trim41Q5NCC3 630 aa26.02■■□□□ 1.76
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ubl4bQ9CQ84 188 aa25.81■■□□□ 1.72
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.72■■□□□ 1.71
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Golga3P55937 1487 aa25.54■■□□□ 1.68
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Mrc2Q64449 1479 aa25.52■■□□□ 1.68
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Top2bQ64511 1612 aa25.5■■□□□ 1.67
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.46■■□□□ 1.67
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.45■■□□□ 1.66
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.43■■□□□ 1.66
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cux2P70298 1426 aa25.36■■□□□ 1.65
Gm20482-201ENSMUST00000172746 TnnQ80Z71 1560 aa25.28■■□□□ 1.64
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Fmn1Q05860 1466 aa25.15■■□□□ 1.62
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.13■■□□□ 1.61
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.04■■□□□ 1.6
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Il27Q8K3I6 234 aa25.02■■□□□ 1.6
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cep164Q5DU05 1446 aa25.02■■□□□ 1.6
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa25.01■■□□□ 1.59
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.01■■□□□ 1.59
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa24.99■■□□□ 1.59
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Chic1Q8CBW7 227 aa24.9■■□□□ 1.58
Gm20482-201ENSMUST00000172746 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Gm20482-201ENSMUST00000172746 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.74■■□□□ 1.55
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Grin2bQ01097 1482 aa24.73■■□□□ 1.55
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Plb1Q3TTY0 1478 aa24.72■■□□□ 1.55
Gm20482-201ENSMUST00000172746 HrcG5E8J6 738 aa24.69■■□□□ 1.54
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Duox2A2AQ99 1517 aa24.67■■□□□ 1.54
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Gm20482-201ENSMUST00000172746 NrkQ9R0G8 1455 aa24.54■■□□□ 1.52
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Efcab5A0JP43 1406 aa24.53■■□□□ 1.52
Gm20482-201ENSMUST00000172746 PtprkP35822 1457 aa24.5■■□□□ 1.51
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.5■■□□□ 1.51
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Ift140E9PY46 1464 aa24.47■■□□□ 1.51
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Shroom4Q1W617 1475 aa24.44■■□□□ 1.5
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Disp1Q3TDN0 1521 aa24.42■■□□□ 1.5
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Setd1bQ8CFT2 1985 aa24.42■■□□□ 1.5
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.34■■□□□ 1.49
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Gab3Q8BSM5 595 aa24.32■■□□□ 1.48
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rusc2Q80U22 1514 aa24.31■■□□□ 1.48
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Magi3Q9EQJ9 1476 aa24.25■■□□□ 1.47
Gm20482-201ENSMUST00000172746 SynmQ70IV5 1561 aa24.21■■□□□ 1.47
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Grin2aP35436 1464 aa24.21■■□□□ 1.47
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Npm2Q80W85 207 aa24.21■■□□□ 1.47
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa24.19■■□□□ 1.46
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa24.18■■□□□ 1.46
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Pla2r1Q62028 1487 aa24.14■■□□□ 1.46
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Zeb1Q64318 1117 aa24.13■■□□□ 1.45
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Arhgap35Q91YM2 1499 aa24.08■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Shroom2A2ALU4 1481 aa24.06■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.06■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Cep162Q6ZQ06 1403 aa24.02■■□□□ 1.44
Gm20482-201ENSMUST00000172746 Map3k1P53349 1493 aa23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 114 ms