RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 NacadQ5SWP3 1504 aa47.27■■■■■ 5.16
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm5dQ62240 1548 aa47.18■■■■■ 5.14
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sycp2Q9CUU3 1500 aa46.35■■■■■ 5.01
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa43.44■■■■■ 4.54
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa43.4■■■■■ 4.54
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam135aQ6NS59 1506 aa43.23■■■■■ 4.51
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Wdr62Q3U3T8 1523 aa43.08■■■■■ 4.49
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Frmpd1A2AKB4 1549 aa43.03■■■■■ 4.48
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Unc13aQ4KUS2 1712 aa42.5■■■■■ 4.39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rtl1Q7M732 1744 aa42.49■■■■■ 4.39
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42.32■■■■■ 4.37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Synj1Q8CHC4 1574 aa42.25■■■■■ 4.35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mrc2Q64449 1479 aa42.24■■■■■ 4.35
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42.01■■■■■ 4.32
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cux2P70298 1426 aa41.46■■■■■ 4.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif15Q6P9L6 1387 aa41.44■■■■■ 4.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa41.39■■■■■ 4.22
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif21aQ9QXL2 1672 aa41.25■■■■■ 4.19
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lamc3Q9R0B6 1581 aa41.17■■■■■ 4.18
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dnajc5P60904 198 aa41.04■■■■■ 4.16
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 TnnQ80Z71 1560 aa40.61■■■■■ 4.09
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc18Q640L5 1455 aa40.6■■■■■ 4.09
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plb1Q3TTY0 1478 aa40.49■■■■■ 4.07
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Camsap1A2AHC3 1581 aa40.42■■■■■ 4.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Shroom2A2ALU4 1481 aa40.41■■■■■ 4.06
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Crocc2F6XLV1 1638 aa40.38■■■■■ 4.05
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fmn1Q05860 1466 aa40.15■■■■■ 4.02
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ift140E9PY46 1464 aa40.09■■■■■ 4.01
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rusc2Q80U22 1514 aa40.03■■■■■ 4
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col17a1Q07563 1470 aa39.93■■■■□ 3.98
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Grin2bQ01097 1482 aa39.83■■■■□ 3.97
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Samd9lQ69Z37 1561 aa39.68■■■■□ 3.94
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Setd1bQ8CFT2 1985 aa39.65■■■■□ 3.94
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa39.54■■■■□ 3.92
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cep170Q6A065 1588 aa39.01■■■■□ 3.84
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa39■■■■□ 3.83
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38.95■■■■□ 3.83
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