RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51.42■■■■■ 5.82
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 ScribQ80U72 1612 aa47.57■■■■■ 5.21
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kdm5dQ62240 1548 aa45.88■■■■■ 4.94
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45.14■■■■■ 4.82
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43.3■■■■■ 4.52
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42.18■■■■■ 4.34
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam135aQ6NS59 1506 aa42.16■■■■■ 4.34
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mrc2Q64449 1479 aa41.17■■■■■ 4.18
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc5P60904 198 aa40.37■■■■■ 4.05
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cux2P70298 1426 aa40.33■■■■■ 4.05
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40.29■■■■■ 4.04
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40.08■■■■■ 4.01
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Camsap1A2AHC3 1581 aa39.21■■■■□ 3.87
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Crocc2F6XLV1 1638 aa39.2■■■■□ 3.87
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38.44■■■■□ 3.74
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Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.95■■■■□ 3.67
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