RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abcc9P70170 1546 aa46.81■■■■■ 5.08
Pdss1-207ENSMUST00000152170 ScribQ80U72 1612 aa45.2■■■■■ 4.83
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kdm5dQ62240 1548 aa43.69■■■■■ 4.58
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43.04■■■■■ 4.48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.93■■■■■ 4.46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 BicraF8VPZ9 1578 aa42.36■■■■■ 4.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42.15■■■■■ 4.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rhox8Q6VSS7 320 aa41.74■■■■■ 4.27
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Baz1aO88379 1555 aa41.56■■■■■ 4.24
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41.49■■■■■ 4.23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41.44■■■■■ 4.23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41.4■■■■■ 4.22
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.3■■■■■ 4.04
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.29■■■■■ 4.04
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.21■■■■■ 4.03
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.19■■■■■ 4.02
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam135aQ6NS59 1506 aa39.92■■■■□ 3.98
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39.86■■■■□ 3.97
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.84■■■■□ 3.97
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.45■■■■□ 3.91
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39.31■■■■□ 3.88
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39.26■■■■□ 3.88
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.24■■■■□ 3.87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.23■■■■□ 3.87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39.11■■■■□ 3.85
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mrc2Q64449 1479 aa39■■■■□ 3.83
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Trim41Q5NCC3 630 aa38.5■■■■□ 3.75
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cux2P70298 1426 aa38.39■■■■□ 3.74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.38■■■■□ 3.74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38.21■■■■□ 3.71
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.13■■■■□ 3.7
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.06■■■■□ 3.68
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cep164Q5DU05 1446 aa37.83■■■■□ 3.65
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Golga3P55937 1487 aa37.8■■■■□ 3.64
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Top2bQ64511 1612 aa37.75■■■■□ 3.63
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TnnQ80Z71 1560 aa37.74■■■■□ 3.63
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cngb1E1AZ71 1325 aa37.65■■■■□ 3.62
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Il27Q8K3I6 234 aa37.6■■■■□ 3.61
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.46■■■■□ 3.59
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fmn1Q05860 1466 aa37.39■■■■□ 3.58
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.35■■■■□ 3.57
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shroom2A2ALU4 1481 aa37.2■■■■□ 3.55
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ift140E9PY46 1464 aa37.11■■■■□ 3.53
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Duox2A2AQ99 1517 aa37.08■■■■□ 3.53
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Grin2bQ01097 1482 aa37■■■■□ 3.51
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rusc2Q80U22 1514 aa36.98■■■■□ 3.51
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.87■■■■□ 3.49
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Efcab5A0JP43 1406 aa36.79■■■■□ 3.48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36.78■■■■□ 3.48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Samd9lQ69Z37 1561 aa36.76■■■■□ 3.47
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col17a1Q07563 1470 aa36.71■■■■□ 3.47
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.64■■■■□ 3.46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NrkQ9R0G8 1455 aa36.58■■■■□ 3.45
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36.55■■■■□ 3.44
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chic1Q8CBW7 227 aa36.53■■■■□ 3.44
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Grin2aP35436 1464 aa36.45■■■■□ 3.43
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36.45■■■■□ 3.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PtprkP35822 1457 aa36.4■■■■□ 3.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shroom4Q1W617 1475 aa36.39■■■■□ 3.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36.27■■■■□ 3.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 SynmQ70IV5 1561 aa36.22■■■■□ 3.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pla2r1Q62028 1487 aa36.22■■■■□ 3.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.17■■■■□ 3.38
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zeb1Q64318 1117 aa36.08■■■■□ 3.37
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Pdss1-207ENSMUST00000152170 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35.98■■■■□ 3.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35.98■■■■□ 3.35
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