RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111018.1

Srp9-202, Transcript of Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Srp9, Length 823 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa60.6■■■■■ 7.29
Srp9-202ENSMUST00000111018 NischQ80TM9 1593 aa59.61■■■■■ 7.13
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc8B2RUS7 1588 aa57.82■■■■■ 6.85
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc9P70170 1546 aa57.61■■■■■ 6.81
Srp9-202ENSMUST00000111018 ScribQ80U72 1612 aa55.97■■■■■ 6.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 NacadQ5SWP3 1504 aa54.22■■■■■ 6.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kdm5dQ62240 1548 aa54.02■■■■■ 6.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Sycp2Q9CUU3 1500 aa53.18■■■■■ 6.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dcaf1Q80TR8 1506 aa53.08■■■■■ 6.09
Srp9-202ENSMUST00000111018 BicraF8VPZ9 1578 aa52.51■■■■■ 6
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa51.87■■■■■ 5.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa51.85■■■■■ 5.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Crybg2B7ZCC2 1516 aa51.18■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Baz1aO88379 1555 aa51.13■■■■■ 5.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc180J3QNE4 1664 aa51.04■■■■■ 5.76
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rhox8Q6VSS7 320 aa50.97■■■■■ 5.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
Srp9-202ENSMUST00000111018 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
Srp9-202ENSMUST00000111018 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP50.44■■■■■ 5.66
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa50.01■■■■■ 5.6
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ercc6F8VPZ5 1481 aa49.98■■■■■ 5.59
Srp9-202ENSMUST00000111018 Smarca2Q6DIC0 1577 aa49.94■■■■■ 5.59
Srp9-202ENSMUST00000111018 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
Srp9-202ENSMUST00000111018 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa49.7■■■■■ 5.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa49.69■■■■■ 5.55
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fam135aQ6NS59 1506 aa49.63■■■■■ 5.54
Srp9-202ENSMUST00000111018 Wdr62Q3U3T8 1523 aa49.39■■■■■ 5.5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Frmpd1A2AKB4 1549 aa49.37■■■■■ 5.49
Srp9-202ENSMUST00000111018 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
Srp9-202ENSMUST00000111018 Baz1bQ9Z277 1479 aa49.15■■■■■ 5.46
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ubl4bQ9CQ84 188 aa48.84■■■■■ 5.41
Srp9-202ENSMUST00000111018 Unc13aQ4KUS2 1712 aa48.52■■■■■ 5.36
Srp9-202ENSMUST00000111018 CftrP26361 1476 aa48.48■■■■■ 5.35
Srp9-202ENSMUST00000111018 Mrc2Q64449 1479 aa48.48■■■■■ 5.35
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa48.33■■■■■ 5.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 Synj1Q8CHC4 1574 aa48.25■■■■■ 5.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rtl1Q7M732 1744 aa48.18■■■■■ 5.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa47.87■■■■■ 5.25
Srp9-202ENSMUST00000111018 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cux2P70298 1426 aa47.51■■■■■ 5.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dnajc5P60904 198 aa47.46■■■■■ 5.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif15Q6P9L6 1387 aa47.42■■■■■ 5.18
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa47.38■■■■■ 5.17
Srp9-202ENSMUST00000111018 Trim41Q5NCC3 630 aa47.31■■■■■ 5.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lamc3Q9R0B6 1581 aa47.15■■■■■ 5.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif21aQ9QXL2 1672 aa47.13■■■■■ 5.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cep164Q5DU05 1446 aa46.79■■■■■ 5.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP46.71■■■■■ 5.07
Srp9-202ENSMUST00000111018 Shroom2A2ALU4 1481 aa46.52■■■■■ 5.04
Srp9-202ENSMUST00000111018 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc18Q640L5 1455 aa46.44■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 TnnQ80Z71 1560 aa46.44■■■■■ 5.03
Srp9-202ENSMUST00000111018 Plb1Q3TTY0 1478 aa46.42■■■■■ 5.02
Srp9-202ENSMUST00000111018 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
Srp9-202ENSMUST00000111018 Il27Q8K3I6 234 aa46.35■■■■■ 5.01
Srp9-202ENSMUST00000111018 Golga3P55937 1487 aa46.31■■■■■ 5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Top2bQ64511 1612 aa46.29■■■■■ 5
Srp9-202ENSMUST00000111018 Camsap1A2AHC3 1581 aa46.2■■■■■ 4.99
Srp9-202ENSMUST00000111018 Crocc2F6XLV1 1638 aa46.16■■■■■ 4.98
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cngb1E1AZ71 1325 aa46.05■■■■■ 4.96
Srp9-202ENSMUST00000111018 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ift140E9PY46 1464 aa45.99■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Col17a1Q07563 1470 aa45.98■■■■■ 4.95
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fmn1Q05860 1466 aa45.89■■■■■ 4.94
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rusc2Q80U22 1514 aa45.85■■■■■ 4.93
Srp9-202ENSMUST00000111018 Duox2A2AQ99 1517 aa45.78■■■■■ 4.92
Srp9-202ENSMUST00000111018 Disp1Q3TDN0 1521 aa45.62■■■■■ 4.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Grin2bQ01097 1482 aa45.58■■■■■ 4.89
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
Srp9-202ENSMUST00000111018 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Efcab5A0JP43 1406 aa45.41■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa45.39■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
Srp9-202ENSMUST00000111018 Samd9lQ69Z37 1561 aa45.33■■■■■ 4.85
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
Srp9-202ENSMUST00000111018 Setd1bQ8CFT2 1985 aa45.25■■■■■ 4.84
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rad54l2Q99NG0 1466 aa45.09■■■■■ 4.81
Srp9-202ENSMUST00000111018 Grin2aP35436 1464 aa45.02■■■■■ 4.8
Srp9-202ENSMUST00000111018 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Magi3Q9EQJ9 1476 aa44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 NrkQ9R0G8 1455 aa44.99■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fgd6Q69ZL1 1399 aa44.98■■■■■ 4.79
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa44.94■■■■■ 4.78
Srp9-202ENSMUST00000111018 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 Adgrl3Q80TS3 1537 aa44.83■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 PtprkP35822 1457 aa44.82■■■■■ 4.77
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa44.72■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm156Q58A37 223 aa44.72■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Shroom4Q1W617 1475 aa44.7■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cep170Q6A065 1588 aa44.69■■■■■ 4.75
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gpatch8A2A6A1 1505 aa44.69■■■■■ 4.74
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pla2r1Q62028 1487 aa44.66■■■■■ 4.74
Srp9-202ENSMUST00000111018 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa44.63■■■■■ 4.73
Srp9-202ENSMUST00000111018 Chic1Q8CBW7 227 aa44.61■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.4 ms