RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109086.7

Ube2b-202, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Ube2b, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42.79■■■■■ 4.44
Ube2b-202ENSMUST00000109086 NischQ80TM9 1593 aa42.14■■■■■ 4.34
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.82■■■■■ 4.13
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Abcc9P70170 1546 aa40.76■■■■■ 4.12
Ube2b-202ENSMUST00000109086 ScribQ80U72 1612 aa39.56■■■■□ 3.92
Ube2b-202ENSMUST00000109086 NacadQ5SWP3 1504 aa38.21■■■■□ 3.71
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Kdm5dQ62240 1548 aa38.18■■■■□ 3.7
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Sycp2Q9CUU3 1500 aa37.49■■■■□ 3.59
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.45■■■■□ 3.59
Ube2b-202ENSMUST00000109086 BicraF8VPZ9 1578 aa37.05■■■■□ 3.52
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36.72■■■■□ 3.47
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa36.47■■■■□ 3.43
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rhox8Q6VSS7 320 aa36.18■■■■□ 3.38
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Baz1aO88379 1555 aa36.15■■■■□ 3.38
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ccdc180J3QNE4 1664 aa36.02■■■■□ 3.36
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.98■■■■□ 3.35
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa35.27■■■■□ 3.24
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ercc6F8VPZ5 1481 aa35.25■■■■□ 3.23
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.22■■■■□ 3.23
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa35.15■■■■□ 3.22
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa35.11■■■■□ 3.21
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Fam135aQ6NS59 1506 aa34.96■■■■□ 3.19
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Wdr62Q3U3T8 1523 aa34.85■■■■□ 3.17
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Frmpd1A2AKB4 1549 aa34.81■■■■□ 3.16
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Baz1bQ9Z277 1479 aa34.41■■■■□ 3.1
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Unc13aQ4KUS2 1712 aa34.35■■■■□ 3.09
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ubl4bQ9CQ84 188 aa34.35■■■■□ 3.09
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rtl1Q7M732 1744 aa34.26■■■■□ 3.07
Ube2b-202ENSMUST00000109086 CftrP26361 1476 aa34.25■■■■□ 3.07
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.19■■■■□ 3.06
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.19■■■■□ 3.06
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Mrc2Q64449 1479 aa34.14■■■■□ 3.06
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa33.93■■■■□ 3.02
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cux2P70298 1426 aa33.52■■■□□ 2.96
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Kif15Q6P9L6 1387 aa33.48■■■□□ 2.95
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa33.45■■■□□ 2.94
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Kif21aQ9QXL2 1672 aa33.34■■■□□ 2.93
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Trim41Q5NCC3 630 aa33.34■■■□□ 2.93
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.29■■■□□ 2.92
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Dnajc5P60904 198 aa33.16■■■□□ 2.9
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cep164Q5DU05 1446 aa32.98■■■□□ 2.87
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
Ube2b-202ENSMUST00000109086 TnnQ80Z71 1560 aa32.85■■■□□ 2.85
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Top2bQ64511 1612 aa32.8■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Il27Q8K3I6 234 aa32.79■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Golga3P55937 1487 aa32.79■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.77■■■□□ 2.84
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Plb1Q3TTY0 1478 aa32.74■■■□□ 2.83
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cngb1E1AZ71 1325 aa32.7■■■□□ 2.82
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.69■■■□□ 2.82
Ube2b-202ENSMUST00000109086 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Shroom2A2ALU4 1481 aa32.66■■■□□ 2.82
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Crocc2F6XLV1 1638 aa32.62■■■□□ 2.81
Ube2b-202ENSMUST00000109086 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Fmn1Q05860 1466 aa32.45■■■□□ 2.79
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ift140E9PY46 1464 aa32.39■■■□□ 2.78
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rusc2Q80U22 1514 aa32.36■■■□□ 2.77
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Duox2A2AQ99 1517 aa32.31■■■□□ 2.76
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Col17a1Q07563 1470 aa32.29■■■□□ 2.76
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Grin2bQ01097 1482 aa32.21■■■□□ 2.75
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Disp1Q3TDN0 1521 aa32.16■■■□□ 2.74
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Samd9lQ69Z37 1561 aa32.1■■■□□ 2.73
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Setd1bQ8CFT2 1985 aa32.01■■■□□ 2.71
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Efcab5A0JP43 1406 aa31.96■■■□□ 2.71
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa31.94■■■□□ 2.7
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa31.91■■■□□ 2.7
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Rad54l2Q99NG0 1466 aa31.9■■■□□ 2.7
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Grin2aP35436 1464 aa31.79■■■□□ 2.68
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Magi3Q9EQJ9 1476 aa31.79■■■□□ 2.68
Ube2b-202ENSMUST00000109086 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
Ube2b-202ENSMUST00000109086 NrkQ9R0G8 1455 aa31.75■■■□□ 2.67
Ube2b-202ENSMUST00000109086 PtprkP35822 1457 aa31.66■■■□□ 2.66
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Fgd6Q69ZL1 1399 aa31.66■■■□□ 2.66
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Chic1Q8CBW7 227 aa31.64■■■□□ 2.66
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Shroom4Q1W617 1475 aa31.63■■■□□ 2.65
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Pla2r1Q62028 1487 aa31.59■■■□□ 2.65
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Adgrl3Q80TS3 1537 aa31.57■■■□□ 2.64
Ube2b-202ENSMUST00000109086 SynmQ70IV5 1561 aa31.55■■■□□ 2.64
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Cep170Q6A065 1588 aa31.53■■■□□ 2.64
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.53■■■□□ 2.64
Ube2b-202ENSMUST00000109086 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa31.52■■■□□ 2.64
Ube2b-202ENSMUST00000109086 AknaQ80VW7 1404 aa31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.7 ms