RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088512.11

Rnps1-201, Transcript of RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rnps1, Length 1,798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1-201ENSMUST00000088512 NischQ80TM9 1593 aa26.18■■□□□ 1.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.04■■□□□ 1.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abcc9P70170 1546 aa25.42■■□□□ 1.66
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.98■■□□□ 1.59
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.7■■□□□ 1.38
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.45■■□□□ 1.34
Rnps1-201ENSMUST00000088512 ScribQ80U72 1612 aa23.37■■□□□ 1.33
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rtl1Q7M732 1744 aa23.34■■□□□ 1.33
Rnps1-201ENSMUST00000088512 NacadQ5SWP3 1504 aa22.94■■□□□ 1.26
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kdm5dQ62240 1548 aa22.91■■□□□ 1.26
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.9■■□□□ 1.26
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.88■■□□□ 1.25
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Baz1aO88379 1555 aa22.68■■□□□ 1.22
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.54■■□□□ 1.2
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Sycp2Q9CUU3 1500 aa22.39■■□□□ 1.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.1■■□□□ 1.13
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.95■■□□□ 1.1
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Trim41Q5NCC3 630 aa21.85■■□□□ 1.09
Rnps1-201ENSMUST00000088512 BicraF8VPZ9 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
Rnps1-201ENSMUST00000088512 HrcG5E8J6 738 aa21.76■■□□□ 1.07
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.51■■□□□ 1.03
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.31■■□□□ 1
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.27■■□□□ 1
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Golga3P55937 1487 aa21.2■□□□□ 0.98
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cep164Q5DU05 1446 aa21.17■□□□□ 0.98
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.09■□□□□ 0.97
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21.06■□□□□ 0.96
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Top2bQ64511 1612 aa20.99■□□□□ 0.95
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa20.81■□□□□ 0.92
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Chic1Q8CBW7 227 aa20.8■□□□□ 0.92
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fmn1Q05860 1466 aa20.78■□□□□ 0.92
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.73■□□□□ 0.91
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.72■□□□□ 0.91
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa20.68■□□□□ 0.9
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.68■□□□□ 0.9
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.66■□□□□ 0.9
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Rnps1-201ENSMUST00000088512 TnnQ80Z71 1560 aa20.51■□□□□ 0.87
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Gab3Q8BSM5 595 aa20.51■□□□□ 0.87
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.46■□□□□ 0.87
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.38■□□□□ 0.85
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Unc13aQ4KUS2 1712 aa20.35■□□□□ 0.85
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.34■□□□□ 0.85
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Fam135aQ6NS59 1506 aa20.25■□□□□ 0.83
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.25■□□□□ 0.83
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.24■□□□□ 0.83
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cep162Q6ZQ06 1403 aa20.21■□□□□ 0.83
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.18■□□□□ 0.82
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Npm2Q80W85 207 aa20.16■□□□□ 0.82
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ubl4bQ9CQ84 188 aa20.16■□□□□ 0.82
Rnps1-201ENSMUST00000088512 NrkQ9R0G8 1455 aa20.15■□□□□ 0.82
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Cux2P70298 1426 aa20.08■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Shroom4Q1W617 1475 aa20.05■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Grin2bQ01097 1482 aa20.04■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Il27Q8K3I6 234 aa20.03■□□□□ 0.8
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Map3k1P53349 1493 aa19.97■□□□□ 0.79
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Myt1lP97500 1187 aa19.95■□□□□ 0.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 PtprkP35822 1457 aa19.94■□□□□ 0.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arhgap35Q91YM2 1499 aa19.94■□□□□ 0.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Efcab5A0JP43 1406 aa19.94■□□□□ 0.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Rnps1-201ENSMUST00000088512 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa19.85■□□□□ 0.77
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Clip1Q922J3 1391 aa19.83■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Mrc2Q64449 1479 aa19.81■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Eea1Q8BL66 1411 aa19.8■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Duox2A2AQ99 1517 aa19.79■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Zeb1Q64318 1117 aa19.78■□□□□ 0.76
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Rnps1-201ENSMUST00000088512 NefmP08553 848 aa19.7■□□□□ 0.74
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Carmil1Q6EDY6 1374 aa19.7■□□□□ 0.74
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.67■□□□□ 0.74
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Crocc2F6XLV1 1638 aa19.64■□□□□ 0.73
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Rnps1-201ENSMUST00000088512 SynmQ70IV5 1561 aa19.62■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Kif21aQ9QXL2 1672 aa19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Erich3F6QRE9 1637 aa19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Rpap1Q80TE0 1409 aa19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19.6■□□□□ 0.73
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Arap1Q4LDD4 1452 aa19.58■□□□□ 0.72
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Samd9lQ69Z37 1561 aa19.57■□□□□ 0.72
Rnps1-201ENSMUST00000088512 Ankrd26Q811D2 1581 aa19.53■□□□□ 0.72
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